Estudia > Oferta formativa > Oferta d'assignatures > Detall de l'assignatura
Anar al contingut (clic a Intro)
UdG Home UdG Home
Tancar
Menú

Estudia

Dades generals

Curs acadèmic:
2008
Descripció:
Obtenció i emmagatzemament de seqüències. Alineament de parells de seqüències. Alineament múltiple. Recerca de seqüències en bases de dades. Predicció d'estructura secundària de RNA. Predicció de gens i regulació. Classificació de proteïnes i predicció d'estructura. Anàlisi genòmic. Anàlisi de micromatrius. Programes bioinformàtics
Crèdits:
6
Idioma principal de les classes:
Català
S’utilitza oralment la llengua anglesa en l'assignatura:
Poc (25%)
S’utilitzen documents en llengua anglesa:
Majoritàriament (75%)

Grups

Competències

  • Capacitat per transmetre coneixements i comunicar-se oralment i per escrit
  • Capacitat de realitzar treball pràctic de laboratori
  • Descriure les principals aplicacions bioinformàtiques per a l’anàlisi de seqüències d’àcids nucleics i proteïnes
  • Aplicar els recursos bioinformàtics per a l’alineament de seqüències i construcció d’arbres filogenètics
  • Utilitzar els principals recursos bioinformàtics emprats a les pràctiques i interpretar correctament els resultats
  • Triar els recursos bioinformàtics adequats per assolir un objectiu concret en prediccions relacionades amb seqüències

Continguts

1. Introducció al desenvolupament dels mètodes d'anàlisis de seqüències d'àcids nucleics i proteïnes

2. Anàlisis de seqüències d'àcids nucleics i proteïnes

          2.1. Anàlisis d'ADN

                    2.1.1. Obtenció i emmagatemament de seqüències

                    2.1.2. Cerca de similituds entre seqüències

                    2.1.3. Alineació de seqüències: parells de seqüències i alineacions múltiples

                    2.1.4. Anàlisis filogenètiques: mètodes per a la construcció d'arbres filogenètics

                    2.1.5. Predicció de proteïnes codificades en fragments d'ADN

          2.2. Anàlisis de proteïnes

                    2.2.1. Obtenció i emmagatzemament de seqüències

                    2.2.2. Cerca de similituds entre seqüències

                    2.2.3. Alineacions de seqüències

                    2.2.4. Anàlisis filogenètiques

3. Anàlisi d'estructures secundàries d'àcids nucleics i proteïnes

          3.1. Predicció de l'estructura secundària de l'ARN

          3.2. Predicció de l'estructura secundària de proteïnes

                    3.2.1. Classificació de proteïnes

                    3.2.2. Bases de dades d'estructures proteiques

                    3.2.3. Alineament d'estructures proteiques

4. Anàlisis de genoma

Activitats

Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Total
Altres 0,50 0 0,50
Exposició dels estudiants 3,00 7,00 10,00
Prova d'avaluació 3,00 0 3,00
Seminaris 2,00 6,00 8,00
Sessió expositiva 11,00 30,00 41,00
Sessió pràctica 24,00 64,00 88,00
Total 43,50 107,00 150,5

Bibliografia

  • David W. Mount (2005). Bioinformatics. Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Avaluació i qualificació

Activitats d'avaluació:

Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat %
Desenvolupament dels continguts Prova presencial 35
Seminaris d'experts Presentació d'un informe 20
Pràctica 1. Anàlisis d'ADN Avauació continuada
Presentació d'informe
25
Pràctica 2. Anàlisis de proteïnes Avaluació continuada
Presentació informe
Pràctica 3. Anàlisi d'estructures secundàries Avaluació continuada
Presentació informe
Discussions de pràctiques Avaluació continuada: participació en les discussions 20
Prova presencial prova presencial

Qualificació

Assistència a pràctiques i seminaris obligatòria
Avaluació continuada: 25%
Prova presencial: 35%. Cal aprovar-la per aprovar l'assignatura
Informes: 20%
Discussions de pràctiques i participació en seminaris: 20%

Observacions

Assignatura molt relacionada amb la de "Tècniques Avançades en Biotecnologia".

Escull quins tipus de galetes acceptes que el web de la Universitat de Girona pugui guardar en el teu navegador.

Les imprescindibles per facilitar la vostra connexió. No hi ha opció d'inhabilitar-les, atès que són les necessàries pel funcionament del lloc web.

Permeten recordar les vostres opcions (per exemple llengua o regió des de la qual accediu), per tal de proporcionar-vos serveis avançats.

Proporcionen informació estadística i permeten millorar els serveis. Utilitzem cookies de Google Analytics que podeu desactivar instal·lant-vos aquest plugin.

Per a oferir continguts publicitaris relacionats amb els interessos de l'usuari, bé directament, bé per mitjà de tercers (“adservers”). Cal activar-les si vols veure els vídeos de Youtube incrustats en el web de la Universitat de Girona.