1. Química de Proteïnes:
1.1. Els aminoàcids i la cadena polipeptídica: propietats fonamentals dels aminoàcids. L’enllaç peptídic i la cadena polipeptídica.
1.2. Estructura proteïca: Nivells d’estructuració proteïca. Principals tipus d’estructura secundària. Estructura supersecundària. Dominis. Estructura terciària Proteïnes fibroses i globulars. Estructura quaternària.
1.3. Estabilitat i dinàmica conformacional: Desnaturalització proteïca. Renaturalització. Fluctuacions, flexibilitat i dinàmica conformacional.
1.4. Modificacions post-traduccionals: Plegament i associació de proteïnes “in vitro” i en el medi intracel.lular. Modificacions de grups terminals i de cadenes laterals. Zimògens. Activació en cascada. Glucoproteïnes.
1.5. Interaccions proteïna-lligand: Propietats dels setis de fixació de lligands en diferents proteïnes.
2. Enzimologia
2.1. Enzims, classificació i nomenclatura: Propietats generals dels enzims. Complex enzim-substrat. Cofactors. Normes de la Comissió Internacional d’Enzims. Principals classes d’enzims.
2.2. Catàlisi i especificitat enzimàtica. Teoria de l’estat de Transició. Teoria de Fisher i Koshland. Especificitat de substrat. Unió enzim-substrat. Anàlegs de substrat. Mecanismes de catàlisi: El centre actiu. Catàlisi àcid-base, electrostática i covalent. Exemples.
2.3. Cinètica enzimàtica: Mesura de l’activitat enzimàtica. Velocitat inicial. Conceptes de cinètica química i enzimàtica. Equació de Michaelis-Menten. Modificació de Briggs-Haldane. Reaccions multisubstrat. Inhibició de la catàlisi enzimàtica. Tipus de inhibició.
3. Enginyeria de Proteïnes: Aplicacions i potencialitat de l’enginyeria de proteïnes.
4. Pràctiques
4.1. Activitat enzimàtica. Estudi d'un enzim (LDH) en base a les seves constants cinètiques. Inhibició enzimàtica. Efecte del pH i la temperatura sobre l'activitat enzimàtica.
4.2. Estudi de l'estructura d'una proteïna. El SDS-PAGE com a eina per esbrinar l'estructura d'una proteïna. Importància de l'estructura d'una proteïna en el reconeixament amb anticossos.
5. Treball continuat durant el curs
5.1. Introducció a la bioinformàtica. Bases de dades de proteïnes. Servidors. Eines on-line per a la recerca en proteïnes. Homologies. Programes de visualització d'estructures de proteïnes. Predicció de models proteics.
L'avaluació final de l'assignatura (4.5 crèdits teòrics + 2.5 crèdits pràctics) es realitzarà en base als criteris següents:
1. Prova final: 50% de la qualificació final. Prova global de l'assignatura en base a qüestions breus que poden estar referides a qualsevol dels continguts de l'assignatura, incloent tant aspectes teòrics com pràctics.
2. Classes pràctiques: 20 % de la qualificació final. Treball en grup de les dades obtingudes durant les pràctiques i dels conceptes teòrics, que es valoraran en un examen final que es farà l'últim dia de pràctiques. També es tindrà en compte el treball al laboratori.
3. Opcional. Realització d'un seminari amb exposició a classe sobre un dels continguts de l'assignatura o un article científic. 10% de la qualificació final. Pot ser fet de manera individual o en grups de dues persones. Es valorarà la capacitat expositiva, el contingut i la claredat en l'argumentació del tema exposat en el seminari.
4. Presentació d'exercicis. 20 % de la qualificació final. En base als continguts que es proporcionaran en diferents sessions es proposaran un seguit d'exercicis i uns terminis de presentació dels mateixos. El calendari es concretarà en l'inici de curs. La presentació dels resultats anirà precedida de sessions de discussió on es podran plantejar els dubtes que generi la realització dels exercicis.
En segona convocatòria només hi haurà la prova final. La resta de les altres activitats que són d'avaluació no són recuperables.