Estudia > Oferta formativa > Oferta d'assignatures > Detall de l'assignatura
Anar al contingut (clic a Intro)
UdG Home UdG Home
Tancar
Menú

Estudia

Dades generals

Curs acadèmic:
2010
Descripció:
Estructura, propietats i funció de les proteïnes. Tècniques de purificació i caracterització de proteïnes. Catalitzadors biològics. Cinètica enzimàtica.
Crèdits:
7
Idioma principal de les classes:
Català
S’utilitza oralment la llengua anglesa en l'assignatura:
Gens (0%)
S’utilitzen documents en llengua anglesa:
Completament (100%)

Grups

Grup A

Durada:
Semestral, 1r semestre
Professorat:
Sílvia Barrabés Vera  / MARIA CONCEPCION PAU GARCIA  / Marc Ribo Panosa

Competències

  • Avaluar activitats metabòliques

Altres Competències

  • Capacitat de treball en equip.
  • Capacitat de síntesi i anàlisi d'informació, seleccionada en funció d'uns objectius determinats.
  • Comunicar-se de manera oral i per escrit, utilitzant el vocabulari científic.
  • Entendre el disseny experimental, ser capaç d'obtenir resultats i interpretar-los a partir d'una guia prèvia.
  • Conèixer les característiques generals i les propietas fisico-químiques de les proteïnes.
  • Conèixer la diversitat de funcions que les proteïnes duen a terme en els éssers vius.
  • Relacionar l’estructura de les proteïnes amb la seva funció.
  • Comprendre com les proteïnes s’organitzen en l’espai i quines interaccions permeten assolir unes determinades disposicions tridimensionals.
  • Conèixer les principals modificacions post-traduccionals i llur paper en l'estructura i funció proteica.
  • Conèixer com actuen els enzims, quin paper juguen com a catalitzadors de les reaccions que tenen lloc en els éssers vius.
  • Conèixer i entendre els fonaments i principis de l’enginyeria de proteïnes i les seves aplicacions.

Continguts

1. Química de Proteïnes:

          1.1. Els aminoàcids i la cadena polipeptídica: propietats fonamentals dels aminoàcids. L’enllaç peptídic i la cadena polipeptídica.

          1.2. Estructura proteïca: Nivells d’estructuració proteïca. Principals tipus d’estructura secundària. Estructura supersecundària. Dominis. Estructura terciària Proteïnes fibroses i globulars. Estructura quaternària.

          1.3. Estabilitat i dinàmica conformacional: Desnaturalització proteïca. Renaturalització. Fluctuacions, flexibilitat i dinàmica conformacional.

          1.4. Modificacions post-traduccionals: Plegament i associació de proteïnes “in vitro” i en el medi intracel.lular. Modificacions de grups terminals i de cadenes laterals. Zimògens. Activació en cascada. Glucoproteïnes.

          1.5. Interaccions proteïna-lligand: Propietats dels setis de fixació de lligands en diferents proteïnes.

2. Enzimologia

          2.1. Enzims, classificació i nomenclatura: Propietats generals dels enzims. Complex enzim-substrat. Cofactors. Normes de la Comissió Internacional d’Enzims. Principals classes d’enzims.

          2.2. Catàlisi i especificitat enzimàtica. Teoria de l’estat de Transició. Teoria de Fisher i Koshland. Especificitat de substrat. Unió enzim-substrat. Anàlegs de substrat. Mecanismes de catàlisi: El centre actiu. Catàlisi àcid-base, electrostática i covalent. Exemples.

          2.3. Cinètica enzimàtica: Mesura de l’activitat enzimàtica. Velocitat inicial. Conceptes de cinètica química i enzimàtica. Equació de Michaelis-Menten. Modificació de Briggs-Haldane. Reaccions multisubstrat. Inhibició de la catàlisi enzimàtica. Tipus de inhibició.

3. Enginyeria de Proteïnes: Aplicacions i potencialitat de l’enginyeria de proteïnes.

4. Pràctiques

          4.1. Activitat enzimàtica. Estudi d'un enzim (LDH) en base a les seves constants cinètiques. Inhibició enzimàtica. Efecte del pH i la temperatura sobre l'activitat enzimàtica.

          4.2. Estudi de l'estructura d'una proteïna. El SDS-PAGE com a eina per esbrinar l'estructura d'una proteïna. Importància de l'estructura d'una proteïna en el reconeixament amb anticossos.

5. Treball continuat durant el curs

          5.1. Introducció a la bioinformàtica. Bases de dades de proteïnes. Servidors. Eines on-line per a la recerca en proteïnes. Homologies. Programes de visualització d'estructures de proteïnes. Predicció de models proteics.

Activitats

Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Total
Anàlisi / estudi de casos 2,00 30,00 32,00
Prova d'avaluació 1,00 20,00 21,00
Seminaris 1,00 10,00 11,00
Sessió expositiva 22,00 10,00 32,00
Sessió pràctica 35,00 20,00 55,00
Total 61,00 90,00 151

Bibliografia

  • Schulz, G.E, Schirmer, R.H (1979). Principles of protein structure. New York [etc.]: Springer.
  • Fersht, Alan (cop. 1999). Structure and mechanism in protein science, : a guide to enzyme catalysis and protein folding. New York: W. H. Freeman and Company.
  • Fersht, Alan (1984). Enzime structure and mechanism (2nd ed). New York: Freeman.
  • Creighton, Thomas E (1993). Proteins, : structures and molecular properties (2nd ed). New York: Freeman.
  • Branden, Carl, Tooze, John (cop. 1999). Introduction to protein structure (2nd ed). New York: Garland.
  • Lesk, Arthur M (cop. 2001). Introduction to protein architecture, : the structural biology of proteins. Oxford, UK: Oxford University Press.
  • Estructura de proteínas (2003). Barcelona: Ariel.
  • Protein engineering, : a practical approach (1992). Oxford [etc.]: Oxford University Press.
  • Mathews, Christopher K, Ahern, Kevin G, Van Holde, K. E (cop. 2002). Bioquímica. Madrid [etc.]: Pearson Educación Addison Wesley.
  • Voet, Donald, Voet, Judith G, Pratt, Charlotte W (cop. 2002). Fundamentals of biochemistry (Upgrade ed). New York [etc.]: Wiley.
  • Berg, Jeremy M, Tymoczko, John L, Stryer, Lubert (cop. 2002). Biochemistry. New York: Freeman and Company.
  • Nelson, David L, Cox, Michael M (2001). Lehninger principios de bioquímica (3ª ed). Barcelona: Omega.

Avaluació i qualificació

Activitats d'avaluació:

Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat %
Classes pràctiques Caldrà exposar una presentació l’últim dia de classe de pràctiques on es reculli la feina realitzada durant una de les pràctiques seguint les pautes que es proporcionaran durant la setmana.

20
Treball continuat durant el curs Resolució d'exercicis. En base a l'exposició dels continguts es proposaran diferents blocs d'exercicis que s'hauran d'anar resolent durant el curs. La presentació dels resultats anirà precedida d'una sessió de dubtes que servirà d'element de discussió conjunta. Per a l'avaluació d'aquesta activitat es tindrà en compte la presentació dels exercicis i el contingut dels mateixos. 20
Seminaris de caràcter optatiu Aquesta activitat és opcional i contribuirà en la nota final de l'assignatura en un 10%. 10
Prova final escrita de preguntes curtes sobre els continguts treballats en les classes expositives de l'assignatura. S'avaluarà la capacitat d'expressar-se per escrit de forma clara i raonada i l'assoliment dels coneixements treballats en les classes expositives. 50

Qualificació

L'avaluació final de l'assignatura (4.5 crèdits teòrics + 2.5 crèdits pràctics) es realitzarà en base als criteris següents:

1. Prova final: 50% de la qualificació final. Prova global de l'assignatura en base a qüestions breus que poden estar referides a qualsevol dels continguts de l'assignatura, incloent tant aspectes teòrics com pràctics.
2. Classes pràctiques: 20 % de la qualificació final. Treball en grup de les dades obtingudes durant les pràctiques i dels conceptes teòrics, que es valoraran en un examen final que es farà l'últim dia de pràctiques. També es tindrà en compte el treball al laboratori.
3. Opcional. Realització d'un seminari amb exposició a classe sobre un dels continguts de l'assignatura o un article científic. 10% de la qualificació final. Pot ser fet de manera individual o en grups de dues persones. Es valorarà la capacitat expositiva, el contingut i la claredat en l'argumentació del tema exposat en el seminari.
4. Presentació d'exercicis. 20 % de la qualificació final. En base als continguts que es proporcionaran en diferents sessions es proposaran un seguit d'exercicis i uns terminis de presentació dels mateixos. El calendari es concretarà en l'inici de curs. La presentació dels resultats anirà precedida de sessions de discussió on es podran plantejar els dubtes que generi la realització dels exercicis.

En segona convocatòria només hi haurà la prova final. La resta de les altres activitats que són d'avaluació no són recuperables.

Observacions

Per als diferents temes de l'assignatura es treballarà amb transparències i/o diapositives. Aquest material estarà disponible per a l'alumne a la pàgina web de l'assignatura de la meva UdG o moodle o mitjançant sol.licitud prèvia al professor.
En aquesta pàgina també s'hi troben enllaços d'interès relacionats amb l'assignatura.

Assignatures recomanades

  • Ampliació de biologia cel·lular
  • Anàlisis microbiològiques
  • Biologia cel·lular
  • Biologia cel·lular vegetal
  • Biologia molecular
  • Bioquímica
  • Física dels processos biològics
  • Genètica
  • Genètica molecular
  • Immunologia
  • Instrumentació bioquímica
  • Matemàtiques per a biòlegs
  • Química per a biòlegs I
  • Química per a biòlegs II
  • Regulació metabòlica
  • Virologia

Escull quins tipus de galetes acceptes que el web de la Universitat de Girona pugui guardar en el teu navegador.

Les imprescindibles per facilitar la vostra connexió. No hi ha opció d'inhabilitar-les, atès que són les necessàries pel funcionament del lloc web.

Permeten recordar les vostres opcions (per exemple llengua o regió des de la qual accediu), per tal de proporcionar-vos serveis avançats.

Proporcionen informació estadística i permeten millorar els serveis. Utilitzem cookies de Google Analytics que podeu desactivar instal·lant-vos aquest plugin.

Per a oferir continguts publicitaris relacionats amb els interessos de l'usuari, bé directament, bé per mitjà de tercers (“adservers”). Cal activar-les si vols veure els vídeos de Youtube incrustats en el web de la Universitat de Girona.