Todas las asignaturas del máster se imparten mediante la metodología docente deaprendizaje basado en problemas, complementadas con seminarios, debates, clases magistrales, talleres de laboratorio y salidas de campo. Esta metodología, basada en el aprendizaje semi autónomo de los estudiantes, tiene como objetivo el aprendizaje cooperativo continuo mediante el desarrollo de competencias personales vinculadas a nuevos conocimientos, habilidades y actitudes necesarios en el campo de la ciencia y tecnología de los recursos hídricos. El alumno recibe un feedback semanal individualizado de su evolución respecto de la adquisición de estas competencias, y su evaluación final (consensuada entre todos los profesores de la asignatura o módulo) corresponde a un 50% de la nota final.