Totes les assignatures del màster s'imparteixen mitjançant la metodologia docent d'aprenentatge basat en problemes, complementades amb seminaris, debats, classes magistrals, tallers de laboratori i sortides de camp. Aquesta
metodologia, basada en l'aprenentatge semi autònom dels estudiants, té per objectiu l'aprenentatge cooperatiu continu mitjançant el desenvolupament de competències personals vinculades a nous coneixements, habilitats i actituds necessaris en el camp de la ciència i tecnologia dels recursos hídrics. L’alumne rep un feedback setmanal individualitzat de la seva evolució respecte l’adquisició d’aquestes competències, i la seva avaluació final (consensuada entre tots els professors de l’assignatura o mòdul) correspon a un 50% de la nota final.