La Càtedra va ser creada el 28 d’octubre de 2004, segons acord de la Junta de Govern de la UdG del mateix dia, amb el nom de Càtedra M. Àngels Anglada. El 31 d'octubre de 2013, el Consell de Govern de la UdG va acordar ampliar el camp d'acció de la Càtedra i modificar-ne el nom. Al suport econòmic inicial de la Diputació de Girona s'hi va afegir el de l'Ajuntament de Castelló d'Empúries i el de l'Ajuntament de Figueres.

La Càtedra va ser dirigida per la professora Mariàngela Vilallonga des de la seva creació i fins el mes de març de 2019, quan Vilallonga va ser nomenada consellera de Cultura de la Generalitat de Catalunya. A partir d'aleshores, la direcció va recaure en Margarida Casacuberta, i Anna Perera va passar a ser la directora adjunta. El mes de setembre de 2020, Mariàngela Vilallonga va reprendre el càrrec de directora de la Càtedra de Patrimoni Literari.