CG3 - Capacitat per estructurar i transmetre oralment i per escrit coneixements i raonaments a diversos tipus de públic (expert i no expert), de forma clara, adecuada original i creativa. CG7 - Capacitat per realitzar treball pràctic de laboratori, formulant hipòtesis de treball, judicis i conclusions, per a la seva aplicació en el camp professional i per respondre als objectius d'una línia d'investigació. CE-2 - Planificar estratègies i triar les eines i les tècniques adequades per assolir un objectiu concret relacionat amb el disseny d'un experiment o el desenvolupament d'una aplicació en l'àmbit de la biotecnologia alimentària. CE-4 - Saber aplicar les tècniques d'anàlisi bioquímic, microbiològic, molecular i cel · lular, i les eines bioinformàtiques necessàries per a l'exercici professional en l'àmbit de la biotecnologia.
1. Introducció general a la bioinformàtica 2. Dades genòmiques. 2.1. Bases de dades i formats de dades 2.2. Motors de cerca. Gens, genomes, altres 3. Anàlisi de seqüències. Alineaments: teoria i pràctica. 4. Genòmica i trancriptòmica 4.1. Predicció gènica i reconeixement de factors de transcripció 4.2. Anàlisi a escala de genoma. Next generation sequencing
Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Total Elaboració individual de treballs 2,00 20,00 22,00 Exposició dels estudiants 3,00 10,00 13,00 Prova d'avaluació 3,00 5,00 8,00 Sessió pràctica 20,00 10,00 30,00 Total 28,00 45,00 73
Basic Local Alignment Search Tool. Recuperat , a http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast& ClustalW2. Recuperat , a http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/ MOLECULAR EVOLUTIONARY GENETICS ANALYSIS MEGA 5. Recuperat , a http://www.megasoftware.net/ Chromas Lite 2.1.1 (free). Recuperat , a http://technelysium.com.au/
Activitats d'avaluació: Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat % Pràctiques d'aula bioinformàtica Realització dels exercicis proposats de forma correcta. 10 Elaboració de treballs Estructuració, claredat, correcció en les eines utilitzades i en les solucions proposades. 25 Exposició de treballs en grup. Capacitat de comunicar els coneixements oralment i de interpretar i analitzar la informació obtinguda. 25 Exercicis d'avaluació Ús correcte de les eines bioinformàtiques. Interpretació dels resultats obtinguts. Correcció en la solució aportada. 40
Assistència a les pràctiques d'aula obligatòria. Realització de tots els treballs i activitats proposades. Per aprovar cal realitzar totes les activitats d'avaluació proposades i obtenir un mínim de 5/10 en la nota global de l'assignatura. Criteris específics de la nota «No Presentat»:No assistència a les activitats presencials d'avaluació. No presentació dels exercicis i proves d'avaluació.