Dades generals
-
Curs acadèmic:
- 2025
-
Descripció:
- Avenços en l'estudi de la genètica i fisiologia dels microorganismes. Mètodes moleculars d'identificació de paràsits, fongs, bacteris i virus. Anàlisi de la diversitat microbiana en mostres complexes, mètodes de fingerprinting. Noves tècniques de cultiu.
-
Crèdits:
- 3
-
Professor responsable:
- Luis Bañeras Vives
Grups
Grup J
-
Durada:
- Semestral, 2n semestre
-
Professorat:
- Luis Bañeras Vives
/ Laura Guerrero Latorre
-
Idioma de les classes:
- Català (50%), Anglès (50%)
Competències
- CB01- Identificar problemes, buscar solucions originals i aplicar-les en un context d'investigació o professional
- CB04- Comunicar de forma clara i concisa els seus coneixements, les seves conclusions i les implicacions ètiques i socials del seu camp de treball a públics especialitzats i no especialitzats ( divulgació científica)
- CB05- Actualitzar i prosseguir els seus estudis de forma auto-dirigida i autònoma, recollint i seleccionant la informació necessària que permeti una investigació original i que aporti nous coneixements
- CE01- Integrar els aspectes metodològics i els continguts de les diferents disciplines de les biociències per al seu estudi a nivell molecular
- CE04- Identificar i analitzar els mecanismes moleculars bàsics que operen en els éssers vius, particularment l'home, així com les seves aplicacions en diferents camps d'investigació
- CE05- Gestionar i planificar l'ús racional de tècniques freqüents en Biología Molecular en noves situacions d'estudi o experimentació
- CE06- Avaluar l'ús i la necessitat de tècniques avançades en biología molecular així com la seva adaptació a necessitats particulars requerides
- CE10- Identificar i generar solucions a problemes plantejats en els àmbits de la Biomediciona Molecular i la Patologia Molecular
Continguts
1. Disseny d’encebadors i sondes moleculars específics per aplicacions de PCR i hibridació in situ (FC i FISH) / Diseño de encebadores y sondas moleculares específicos para las aplicaciones de PCR y hibridación in situ (FC y FISH).
2. Identificació i/o quantificació de microorganismes mitjançant hibridació amb sondes moleculars (FISH, CARD-FISH, RING-FISH,...) / Identificación y/o cuantificación de microorganismos mediante hibridación con sondas moleculares (FISH, CARD-FISH, RING-FISH,...)
3. Tècniques d’amplificació de marcadors gènics. Reacció en cadena de la polimerasa (PCR). Optimització i aplicacions. Nested-PCR, PCR quantitativa (qPCR), PCR basada en transcriptasa reversa (RT-PCR), Multiplex- PCR, Rapid Multiplex nested PCR-ICT assay, Multiple displacement amplification (MDA). Clonació. / Técnicas de amplificación de marcadores génicos. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Optimización y aplicaciones. Nested-PCR, PCR cuantitativa (qPCR), PCR basada en transcriptasa reversa (RT-PCR), Multiplex- PCR, Rapid Multiplex nested PCR-ICT assay, Multiple displacement amplification (MDA). Clonación.
4. Mètodes immunologics per la identificació de bacteris i paràsits d’interès sanitari. / Métodos inmunológicos para la identificación de bacterias y parásitos de interés sanitario.
5. Seqüenciació massiva de ADN (metagenòmica) i ARN (metatrancriptòmica). Revisió de plataformes de seqüenciació i tractament bioinformàtic de les dades. MiSeq (Illumina); Nanopore; Ion torrent / Secuenciación masiva de ADN (metagenómica) y ARN (metatrancriptómica). Revisión de plataformas de secuenciación y tratamiento bioinformático de datos: MiSeq (Illumina); Nanopore; Ion torrent
6. Introducció a la Metaproteòmica i Metabolòmica per a l'estudi de microorganismes/ Introducción a la Metaproteómica i Metabolómica para el estudio de microorganismes
Activitats
|
Tipus d’activitat |
Hores amb professor |
Hores sense professor |
Hores virtuals amb professor |
Total |
| Elaboració individual de treballs |
2,00 |
35,00 |
0
|
37,00 |
| Seminaris |
8,00 |
16,00 |
0
|
24,00 |
| Sessió expositiva |
14,00 |
0
|
0
|
14,00 |
|
Total |
24,00 |
51,00 |
0
|
75 |
Bibliografia
- Persing, David H. (cop. 2004 ). Molecular microbiology : diagnostic principles and practice . Washington, D.C.: ASM Press. Catàleg
- Gerhardt, Philipp (1994 ). Methods for general and molecular bacteriology . Washington, D.C.: American Society for Microbiology. Catàleg
- Sachse, Konrad Frey, Joachim (cop. 2003 ). PCR detection of microbial pathogens . Totowa, N.J.: Humana Press. Catàleg
- Bartlett, John M. S. Stirling, David (cop. 2003 ). PCR protocols (2nd ed.). Totowa, N.J.: Humana Press. Catàleg
- Bhunia, Arun K. (cop. 2005 ). Foodborne pathogens : microbiology and molecular biology . Norfolk: Caister Academic Press. Catàleg
- Sninsky, John J. (cop. 1995 ). PCR strategies. San Diego [Calif.] [etc.]: Academic Press. Recuperat 09-07-2013, a http://www.sciencedirect.com/science/book/9780123721822 Catàleg
- Patrinos, George P. Ansorge, Wilhelm, 1944- (2010 ). Molecular diagnostics (2nd ed). Boston: Elsevier/Academic Press. Recuperat 09-07-2013, a http://www.sciencedirect.com/science/book/9780123745378 Catàleg
Avaluació i qualificació
Activitats d'avaluació:
|
Descripció de l'activitat |
Avaluació de l'activitat |
% |
Recuperable |
| Exàmens de seminaris impartits / Exámenes de seminarios impartidos |
Es valorarà la capacitat de comprensió, anàlisi i comunicació. |
50 |
Sí |
| Presentació d'un treball de revisió sobre mètodes moleculars de detecció de microorganismes d'interès / Presentación de un trabajo de revisión sobre métodos moleculares de detección de microorganismos de interés. |
S'avaluarà la capacitat de comunicació (llenguatge, ortografia, presentació, comprensió) i el nivell tècnic i científic de resolució del cas plantejat aplicant els coneixements desenvolupats a l'assignatura. |
50 |
Sí |
Qualificació
La qualificació de l'assignatura es farà amb un sistema combinat que inclou dos tipus d'avaluació diferents:
/ La calificación de la asignatura se realizará con un sistema combinado que incluye dos tipos de avaluación diferentes:
A) 2 Exàmens dels seminaris impartits (25% de la nota cadascun, 50% de la nota final): El professor prepararà dos exàmens de dos seminaris impartits a l'aula. Els exàmens es faran a l'aula a l'horari establert.
A) 2 Exámenes de los seminarios impartidos (25% de la nota cada uno, 50% de la nota final): El professor preparará dos exámenes de dos seminarios impartidos en el aula. Se realizarán en el aula en el horario establecido.
B) Treball de revisió (50% de la nota final): Consistirà en un treball de revisió sobre mètodes de detecció d'un determinat microorganisme d'interès. Els estudiants hauran de fer servir els coneixements adquirits dels diferents mètodes exposats a classe per abordar un aspecte concret de l'estudi d'un microorganisme rellevant. El treball de revisió computarà un 30% i l'exposició d'aquest treball en format de seminari davant els companys computarà un 20%. Els/les estudiants poden fer ús de les plataformes de IA per preparar les seves exposicions, p.e. generació d'imatges i revisió gramatical. Cal indicar-ho convenientment.
B) Trabajo de revisión (50% de la nota final): Consistirá en un trabajo de revisión sobre métodos de detección de un determinado microorganismo de interés. Los estudiantes deberán de utilizar los conocimientos adquiridos de los diferentes métodos expuestos en clase para abordar un aspecto concreto del estudio de un microorganismo relevante. El trabajo de revisión computará un 30% y la exposición de este trabajo en formato de seminario computará un 20%. Los/las estudiantes pueden utilizar plataformas de IA para preparar sus exposiciones, p.e. generación de imágenes y revisión gramatical. Es necesario indicarlo convenientmente.
Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Constarà com a No Presentat tot aquell estudiant que no s'hagi presentat a cap de les dues activitats avaluables. Per tant, la presentació a una sola de les activitats suposarà Presentat.
/ Constará como No Presentado todo aquel estudiante que no se haya presentado a ninguna de las dos actividades avaluables. Por tanto, la presentación a una sola de las actividades supondrá Presentado.
Avaluació única:
L'estudiant tindrà opció de manera excepcional a acollir-se a l'avaluació única tal i com es recull a La nova normativa d’avaluació de la UdG com així ho recull i especifica amb més detall el reglament de la FC. L'avaluació única consistirà en entregar un sol treball per escrit on s'integrin les diferents activitats d'avaluació.
El estudiante tendrá opción de manera excepcional a acogerse a la avaluación única tal y como se recoge en la nueva normativa de avaluación de la UdG así como lo recoge y especifica con más detalle el reglamento de la FC. La avaluación única consistirá en entregar un solo trabajo por escrito donde se integren las diferentes actividades de evaluación.
Requisits mínims per aprovar:
Per considerar superada l’assignatura, caldrà obtenir una qualificació mínima de 5.0
Tutoria
Les tutories es portaran a terme prèviament acordades amb els estudiants, ja siguin de forma presencial o bé de forma telemàtica si no pot ser presencialment (pels motius que siguin) utilitzant en aquest darrer cas els canals habilitats per la Universitat
Las tutorías se llevaran a cabo préviamente acordadas con los estudiantes, ya sean de forma presencial o bien de forma telemática si no pueden ser presencialmente (por qualquier motivo) utilizando en este último caso los canales habilitados por la Universidad.
Comunicació i interacció amb l'estudiantat
La comunicació amb l'estudiantat es farà mitjançant correu electrònic i a través dels avisos i notícies del moodle de l'assignatura.
La comunicación con los estudiantes se llevará a cabo mediante correo electrónico y a través de los avisos y noticias del moodle de la asignatura.
Observacions
Les classes de contingut teòric s'impartiran en forma de classes expositives amb suport audio-visual. Pel caràcter que es suposa a uns estudis de Tercer Cicle, les classes pretenen ser essencialment participatives i estimular la discussió dels continguts de l'assignatura. Per tant, es recomana mantenir una actitud activa i participativa. / Las clases de contenido teórico se impartirán en forma de clases expositivas con soporte audio-visual. Por el carácter que se le supone a unos estudios de Tercer Ciclo, las clases pretenden ser esencialment participativas y estimular la discusió de los contenidos de la asignatura. Por tanto, se recomienda mantener una actitud activa y participativa.
Assignatures recomanades
- Bioinformàtica
- Comunicació científica. Protecció i explotació de resultats
- Patogenicitat microbiana. Fonaments moleculars