Además de la actividad que se desarrolla en el seno de los departamentos, de los institutos de investigación y de las cátedras especializadas, la Universitat de Girona cuenta con 101 grupos de investigación, que son la base del proceso investigador. En los grupos se unen los esfuerzos del profesorado que coincide con intereses comunes y unos mismos objetivos, más allá de la actividad global del departamento.
Dada la diversidad de áreas de conocimiento, la estructura de los grupos de investigación de la UdG responde a estas cinco grandes unidades: técnica, experimental, humanidades, salud, social.