La recerca en aquesta línia està centrada en la caracterització de microorganismes que siguin d'utilitat en bioenginyeria tant en aplicacions tecnològiques i ambientals, en relació en processos de depuració, potabilització i reciclatge de l'aigua, bioremediació de sòls i aigues contaminades, processos electroquímics en reactors biològics, bioprotecció enfront de patògens de vegetals i microorganismes implicats en les desviacions sensorials de productes derivats del suro.