Les sortides professionals són molt àmplies, perquè cada vegada més la cromatografia està present a més laboratoris, no tan sols analítics sinó també biomèdics. Les indústries on hi ha demanda d’especialistes són principalment les alimentàries, les farmacèutiques, les veterinàries, les petroquímiques i les químiques. A més, cal esmentar els laboratoris de control sanitari, de control ambiental i de control forense, i molts laboratoris de recerca, tant els pròpiament analítics com els de suport a grups de recerca químics, bioquímics, mèdics, etc. La formació adquirida durant el màster capacita els alumnes per assolir alts nivells de responsabilitat en qualsevol dels àmbits esmentats.