EcoAqua col·labora amb altres grups en diferents projectes de microbiologia ambiental i d’ecologia microbiana. L’objectiu principal és, en tots els casos, entendre la composició i les estructures de diferents comunitats bacterianes i com aquestes interactúen amb el seu entorn, estudiant entre altres aspectes, la diversitat i l’activitat d’aquestes comunitats.

Projectes actuals:

• Diversitat microbiana de llacunes mediterrànies
• Els arqueus i el cicle de nutrients als llacs
• Diversitat i activitat dels microorganisms transformadors del Nitrogen
• Efectes de la temperature en els epífits algals

Diversitat microbiana de llacunes mediterrànies

Investiguem la diversitat i la abundància de bacteris, arqueus i picoeucariotes de llacunes costeres confinades. Aquestes masses d’aigua estan dominades per entrades sobtades d’aigua marina en situació de temporals, per poques entrades d’aigua dolça i per llargs períodes de confinament en els que les llacunes s’assequen, causant un augment de la salinitat.

Combinem tècniques molècules (qPCR i seqüenciació de DNA) per identificar els patrons de dominància dels diferents grups microbians en els períodes de confinament i estudiar les dinàmiques de nutrients d’aquestes llacunes. Ens concentrem en estudiar el cicle del Nitrogen a partir d’estudiar-ne els gens funcionals que hi estan implicats.

Els arqueus i el cicle de nutrients als llacs

Investiguem la diversitat, la abundància i l’activitat potencial dels grups d’arqueus mesofílics incultivables que habiten als sediments de llacs per tal d’investigar el seu paper en els processos de mineralització del carboni orgànic. Combinem diferents tècniques moleculars (qPCR, seqüenciació de DNA i la metagenòmica) per identificar els grups principals d’arqueus que estan implicats en aquest processos.

Diversitat i activitat dels microorganismes transformadors del nitrogen

El cicle natural del Nitrogen (N) és complex i inclou moltes reaccions de transformació d’aquests compostos. En aquests cicles, els microorganismes hi juguen un paper clau, i sovint exclusiu, ja que són ells els que realitzen moltes d’aquestes reaccions.

A EcoAqua ens interessen especialment els bacteris transformadors del N i les seves activitats de nitrificació i desnitrificació. Així doncs, investiguem la contribució d’aquests microorganismes en el cicle del N en ambients diferents, com poden ser aigües subterrànies contaminades amb N, aiguamolls naturals o artificials i en sèries temporals de fronts glaciars. També ens interessa estudiar la interacció plantes - bacteris i com les plantes seleccionen certs microorganismes transformadors del N a les seves arrels.

Efectes de la temperatura en els epífits algals

Els boscos marins de Cystoseira del Mar Mediterràni i de tot el món estàn en regressió. L’augment continuat de la temperatrua de l’aigua del mar és una de les raons que expliquen aquesta disminució de les poblacions de Cystoseira.

A EcoAqua investiguem l’estructura de les comunitats microbianes que habiten a la superfície dels individus de Cystoseira mediterranea i Cystoseira crinita per tal d’evaluar els efectes que l’augment de la temperatura té en el desenvolupament de microorganismes agarolítics que poden contribuir a la descomposició d’aquestes algues.