1. Introducció general a la bioinformàtica, data science i Big data. Organització de projectes d'anàlisi de dades.
2. Introducció a sistemes informàtics basats en UNIX. Fonaments del treball des de la línia de comandes.
3. Introducció a R i Rstudio. R com a entorn d'anàlisi estadística. Fluxos de treball reproduïbles en ciència de dades. Llenguatges de Markup per garantir la reproductibilitat de les anàlisis.
4. Eines avançades d'R. Les dades "endreçades" amb el paquet tidyverse. Producció de gràfiques d'alta qualitat amb el paquet ggplot.
5. Tractament i anàlisi de dades de seqüenciació massiva. Control de qualitat, "trimming", ensamblatge, mapejat.
6. Fluxos de treball bioinformàtics: conceptes de workflow, pipeline. Introducció al treball en gestors de fluxos de treball (galaxy). Treball amb casos pràctics.
7. Gens i genomes. Bases de dades i navegadors genòmics. Introducció a les diferents capes d'informació genòmica.
La nota de l'assignatura prové de la resolució d'exercicis (a l'aula o a casa, que s'hauran d'entregar) i d'un treball plantejat pel professor, que caldrà entregar al final de l'assignatura.
L’ús d’eines d’intel·ligència artificial només es permet per millorar l’ortografia, la gramàtica i la claredat dels textos. En tots els casos, és obligatori citar les eines utilitzades i declarar-ne l’ús específic.
Si en qualsevol mena d'activitat acadèmica es detecta la utilització, l’intent d’utilització o la tinença de qualsevol sistema, dispositiu o tecnologia que permeti o pugui permetre a l’estudiantat posar-se en contacte amb agents externs o rebre ajuda no autoritzada, així com qualsevol modalitat de còpia dels exercicis exigits en l’avaluació d’una assignatura, aquesta quedarà suspesa.
Es consideren també activitats fraudulentes la utilització d'informació sense autorització, utilització d'informació falsa, suplantació de la identitat, plagis totals o parcials, compra i venda de proves, pràctiques i treballs, etc. i per tant, en aquests casos l'estudiantat implicat suspendrà automàticament l'assignatura amb independència del procés disciplinari que es pugui seguir contra l’estudiant infractor (article 21 de Normativa reguladora dels processos d’avaluació i qualificació dels estudiants, aprovada en el Consell de Govern en la sessió 53/2026, de 5 de juny de 2026 (eBOU-4540)).
Queda absolutament prohibit realitzar qualsevol tipus de gravació, fotografia o enregistrament audiovisual de les activitats docents, a menys que el professorat implicat l’autoritzi explícitament.
Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Es considerarà no presentat l'alumne que no presenti cap dels treballs que el professor demani s'han de presentar.
Avaluació única:
L'avaluació única la podran seguir els alumnes que la facultat autoritizi i constarà d'un examen que inclourà els continguts de teoria i les presentacions de la resta d'alumnes.
Requisits mínims per aprovar:
Per considerar superada l’assignatura, caldrà obtenir una qualificació mínima de 5.0.