Tota innovació comença per la recerca (creació de coneixement) i el consegüent desenvolupament d’aplicacions. La major part de la recerca científica i tecnològica es realitza a les universitats, on tot el personal acadèmic són investigadors.
La Universitat de Girona té 60 grups de recerca d’excel·lència reconeguts per la Generalitat de Catalunya, que pertanyen a 27 departaments i instituts de recerca universitaris, dels quals 10 són grups TECNIO i pels centres de recerca vinculats: Institut Català de Recerca de l'Aigua (ICRA-CERCA), Institut Català de Recerca en Patrimoni Cultural (ICRPC-CERCA), i l’Institut d’Investigació Biomèdica de Girona (IdIBGi-CERCA). Tots ells estan a disposició de les empreses i institucions.