Los diferentes estados vibracionales posibles de una molécula se traducen en un conjunto de niveles de energía. La separación entre estos niveles de energía cae dentro de la región infrarroja del espectro electromagnético. Para obtener el espectro de IR, se hace interaccionar el rayo de luz infrarroja con la muestra, y se registra la cantidad de energía absorbida a cada longitud de ola.

Con la excepción de los enantiòmers, no hay dos moléculas que tengan el mismo espectro de IR. Podemos distinguir dos zonas al espectro de IR según las vibraciones que se observan:
 

• Entre 4000 y 1300 cm^-1: se suelen observar una serie de bandas de absorción provocadas por vibraciones de tensión sencillas, es decir entre dos átomos de la molécula. Identifican a grupos funcionales.
• Entre 1400 y 600 cm^-1: se suelen observar bandas de absorción de vibraciones moleculares, cuya asignación es más difícil, ya que cada una de ellas está generada por absorciones individuales sumadas (vibraciones complejas). Por otra parte, en esta zona, las pequeñas diferencias en la estructura de la molécula dan lugar a variaciones importantes en los máximos de absorción. Por lo tanto, son características de un compuesto determinado y es por eso que esta zona del espectro recibe el nombre dehuella dactilar.

EL'FT-IR es una de las técnicas espectroscópicas más versátiles y de mayor aplicación en la caracterización e identificación de materiales (polímeros, plásticos, sólidos inorgánicos), análisis de productos farmacéuticos y de síntesis, análisis de contaminantes, ciencia forense, biomedicina, agricultura y alimentación entre otros.

• Panfleto del Bruker Alpha FT-IR Spectrometer
• Especificaciones para el Bruker Alpha FT-IR Spectrometer