La meva activitat de recerca s'ha centrat principlament en els estudis d'ecologia microbiana, amb un elevat component molecular, principalment amb microorganismes anaeròbics, amb els que realitzem estudis d'activitat, de fisiologia i d'adaptació, tan en entorns naturals com en sistemes biotecnològics. La meva activitat m'ha proporcionat l'experiència necessaria per participar en múltiples línies de recerca en les que els microorganismes en general, i els anaeròbics en particular, hi tenen un paper especialment rellevant. Em centro en l'anàlisi dels cicles biogeoquímics del carboni i del nitrogen, especialment en com aquests contribueixen a les emissions de gasos d'efecte hivernacle. En la meva recerca apliquem múltiples metodologies, com ara l'aïllament i caracterització de microorganismes, l'anàlisi filogenètica, anàlisis d'expressió i modificació gènica, la biología molecular i tècniques analítiques avançades a la resolució d'un mateis problema. Pel que fa a les línies de recerca en les que he col·laborat més intensament en el passat, m'agradaria destacar destacar: Ecologia microbiana de sòls àrids y semiàrids. 2020-actualitat. Bioremediació anaeròbica. 2016-actualitat. Producció de químics per fermentació. 2012-actualitat. Estudi dels mecanismes de transferència d'electrons en sistemes bioelectroquímics. 2012-actualitat. Contribució dels microorganismes a la producció de males olors en suro. 2008-2012. Desenvolupament de microorganismes antagonistes per a tractament post-collita. 2002- 2008. Anàlisi del cicle del Nitrogen en sistemes naturals i artificials. 1996-2018.