El butlletí BIOVEGEN informa sobre una cerca de socis d'una empresa forestal peruana on es pretén escollir les millors llavors botàniques per a les plantacions.
El butlletí BIOVEGEN és una eina per sistematitzar i facilitar el contacte entre la comunitat científica i empresarial en l'àmbit de la Biologia Vegetal, promovent la generació de col·laboracions públic-privat i/o projectes conjunts de R+D a través de la mobilització d'Oferta i Demanda Tecnològica.
En aquest nou butlletí ens informa d'una demanda tecnològica en relació a cultius forestals.
Títol de la proposta: BÚSQUEDA DE SOCI PER UN PROJECTE R+D+I D'EMPRESA FORESTAL PERUANA: Eines moleculars per producció forestal.
Breu descripció:
L'ús de llavor botànica seleccionada és una font de material genètic per a les plantacions. No obstant això, a causa de la seva alta variabilitat genètica i al llarg temps necessari per poder avaluar moltes de les seves característiques (tals com les propietats comercials de la fusta) l'èxit a escollir als millors individus és limitat.
En el present projecte s'utilitzaràn dos eines moleculars de la genòmica:
- Genotipat per seqüenciació (GBS en anglès) per la generació d'una gran quantitat de SNPs (polimorfismes de nucleòtid simple) d'una població seleccionada d'arbres de plantació.
- Posteriorment, s'utilitzaran aquests marcadors conjuntament amb un conjunt de característiques fenotípiques heretables de cascun d'aquests arbres per estudis d'associació del genoma complet.
Objectius de la proposta:
Trobar, primer SNPs i posteriorment gens candidats associats a aquestes característiques que permetin fer una selecció molt més efectiva d'individus d'èlit per a les plantacions.
Addicionalment existeixen altres eines genòmiques disponibles en la literatura, tals com el genoma seqüenciat i una col·lecció de transcriptomas de teixits
lignificats en la literatura, que servirà de suport i ajudarà al propòsit del projecte de tenir els millors individus per a biomassa forestal maderable.
Cultius: Forestal
Possibles aplicacions: Es pretén generar variïs milers de SNP's (Single Nucleotide Polymorphisms) a través d'un proveïdor de serveis per determinar. Amb aquestes dades de seqüencia i amb les dades generats per la fenotipificació d'aprox. 500 arbres de plantacions, es procediria a un estudi de tipus GWAS.
Tipus d'entitat d'interès: Empresa amb experiència en realització d'estudis d'associació del genoma complet (Genome Wide Association Studies). Idealment, l'empresa podria estar interessada en un estudi del tipus GWAS en altres espècies diferents descrites del projecte.
Altres comentaris: L'empresa proponent té un actiu programa de R+D al que ara es pretén agregar un enfocament genómic. Idealment, el projecte servirà també per a l'entrenament de personal de l'empresa.
Per a qualsevol consulta podeu contactar tant amb BIOVEGEN (Gonzaga Ruiz de Gauna gruizgauna@invegen.org) i la Unitat de Valorització de l'OITT (valoritzacio@udg.edu).