Dra.  MARGARITA MARTINEZ MEDINA

Plana personal

Departament:
BIOLOGIA
Àrea de coneixement:
MICROBIOLOGIA
Grup de recerca:
Microbiologia clínica i Malalties infeccioses

Currículum abreujat

Activitats de caràcter científic o professional

2001-2010 Professor Associat Tipus 2, a temps complet Universitat de GironA

02-09/2010 Professor Associat Tipus 3, a temps complet Universitat de Girona

09/2010-11/2011 Investigador Post-Doc, a temps complet UNIVERSITÉ D’AUVERGNE

11/2012-11/2016 Professor Lector Universitat de Girona

des de 11/2016 Professor Agregat interí UNIVERSITAT DE GIRONA


Formació acadèmica

LLiCENCIADA EN BIOLOGIA, UNIVERSITAT DE GIRONA, 2001

DIPLOMA ESTUDIS AVANÇATS, UNIVERSITAT DE GIRONA, 2003

Títol: Anàlisi i enriquiment de bacteris verds del sofre bentònics de l’estanyol d’en Sisó. Director: Dr. Jesús Garcia Gil

DOCTORAT EN BIOLOGIA, UNIVERSITAT DE GIRONA, 2009

Títol: Intestinal Microbiology in Crohn’s Disease: A study of Escherichia coli as a potential etiologic agent. Director: Dr. Jesús Garcia Gil

Menció Europea

Premi Extraordinari de Doctorat en Biologia de l’any 2009 per la UdG

Premi millor tesi doctoral 2010 per l’IdIbGi

 

Acreditacions obtingudes

2011 Profesor Ayudante Doctor ANECA

2016 Profesor Contratado Doctor  ANECA

2016 Professor Agregat AQU


Participació en projectes competitius

2016-2018

Genòmica i transcriptòmica comparative per identificar gens implicats en el fenotip AIEC. MPCUdG2016/009.

VUDG - Universitat de Girona (UdG). Investigador/a principal: Margarita Martínez Medina

2014-2016

Determinantes genéticos implicados en el patotipo Escherichia coli adherente invasiva (AIEC) para su identificación en la enfermedad de Crohn. SAF2013-43284-P.

MECO - Ministerio de Economía y Competitividad. Investigador/a principal: Margarita Martínez Medina

2011 -2013

Escherichia coli Adherente Invasiva (AIEC): prevalencia en otras enfermedades intestinales diferentes de Crohn y determinantes genéticos implicados en su patogenicidad. SAF2010-15896.

Ministerio de Ciencia e Innovación. Investigador/a principal: Dr. L. Jesús Garcia Gil

2010-2012

Virulence de souches de Escherichia coli invasives dans un modèle murin mimant la susceptibilité des patients atteints de maladie de Crohn

Région Auvergne. Investigador/a principal: Dr. Nicolas Barnich

2007-2008

Desenvolupament i aplicació de sistemes de detecció molecular de bacteris per a la millora del diagnòstic de la pneumònia adquirida a la comunitat greu i el coneixement dels agents etiopatogèncics implicats

Fundació Privada Institut d’Investigació Biomèdica de Girona Dr. Josep Trueta. Investigador/a principal: Dr. L. Jesús Garcia Gil

2006-2009

Estudio de la microbiota asociada a la Enfermedad Inflamatoria Intestinal para la selección de marcadores bacterianos específicos y su aplicación al diagnóstico de la enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa. SAF2006-00414.

Ministerio de Educación y Ciencia. Investigador/a principal: Dr. L. Jesús Garcia Gil

2003-2006

Diversidad de microorganismos Archea en ecosistemas acuáticos templados. Dinámica, actividad metabólica e impacto en el ciclo biogeoquímico del carbono. REN2003-08333-C02-01.

Ministerio de Ciencia y Tecnología. Investigador/a principal: Dr. Carles Borrego Moré


Publicacions

2016

Mireia Lopez Siles, Sylvia Duncan, Jesús Garcia-Gil, and Margarita Martinez-Medina. Faecalibacterium prausnitzii: from microbiology to diagnostics and prognostics. The ISME Journal. In press.

M Balfegó; S Canivell; F A. Hanzu; A Sala-Vila; M Martínez-Medina; S Murillo; T Mur; E G. Ruano; F Linares; N Porras; S Valladares; M Fontalba; E Roura; A Novials; C Hernández; G Aranda; A Sisó-Almirall; G Rojo-Martínez; R Simó; R Gomis. Effects of sardine-enriched diet on metabolic control, inflammation and gut microbiota in drug-naïve patients with type 2 diabetes: a pilot randomized trial. Apr 18;15:78. doi: 10.1186/s12944-016-0245-0.

J. Vila, E. Saez-Lopez, J. R. Johnson, U. Romling, U. Dobrindt, R. Canton, C. G. Giske, T. Naas, A. Carattoli, M. Martinez-Medina, J. Bosch, P. Retamar, J. Rodriguez-Bano, F. Baquero and S. M. Soto. Escherichia coli: an old friend with new tidings. Mar 8. pii: fuw005. [Epub ahead of print]

Agus A, Denizot J, Thévenot J, Martinez-Medina M, Massier S, Sauvanet P, Bernalier-Donadille A, Denis S, Hofman P, Bonnet R, Billard E, Barnich N. Western diet induces a shift in microbiota composition enhancing susceptibility to Adherent-Invasive E. coli infection and intestinal inflammation. Scientific Reports 8(6): 19032

M. Lopez-Siles, M. Martinez-Medina, R. Surís-Valls, X. Aldeguer, M. Sabat-Mir, S. H. Duncan, H. J. Flint, and L. J. Garcia-Gil. Changes in the abundance of Faecalibacterium prausnitzii phylogroups I and II in the intestinal mucosa of inflammatory bowel disease and colorectal cancer patients. Inflammatory Bowel Diseases 22(1):28-41

2015

Lopez-Siles M, Martinez-Medina M, Abellà C, Busquets D, Sabat-Mir M, Duncan SH, Aldeguer X, Flint HJ, Garcia-Gil LJ. Mucosa-associated Faecalibacterium prausnitzii phylotype richness is reduced in patients with inflammatory bowel disease. Applied and Environmental Microbiology 81: 7582-7592

Busquets D, Mas-de-Xaxars T, López-Siles M, Martinez-Medina M, Bahí A, Sàbat M, Louvriex R, Miquel-Cusachs JO, Garcia-Gil JL, Aldeguer X. Anti-tumour Necrosis Factor Treatment with Adalimumab Induces Changes in the Microbiota of Crohn's Disease. Journal of Crohn's and Colitis 9: 899-906

Massart S, Martinez-Medina M, Jijakli H. Biological control in the microbiome era: Challenges and opportunities. Biological Control 89:98-108.

2014

Lopez-Siles M, Martinez-Medina M, Busquets D, Sabat-Mir M, Duncan S, Flint H, Aldeguer X, Garcia-Gil L. Mucosa-associatedFaecalibacterium prausnitzii and Escherichia coli co-abundance can distinguish Irritable Bowel Syndrome and Inflammatory Bowel Disease phenotypes. Int J Med Microbiol 304(3-4): 464-475.

Martinez-Medina M, Denizot J, Dreux N, Robin F, Billard E, Bonnet R, Darfeuille-Michaud A, Barnich N. Western diet induces dysbiosis with increased E coli in CEABAC10 mice, alters host barrier function favouring AIEC colonisation. Gut 2014;63(1):116-24.

2013

Dreux N, Denizot J, Martinez-Medina M, Mellmann A, Billig M, Kisiela D, Chattopadhyay S, Sokurenko E, Neut C, Gower-Rousseau C, Colombel J-F, Bonnet R, Darfeuille-Michaud A, Barnich N. Point Mutations in FimH Adhesin of Crohn's Disease-Associated Adherent-Invasive Escherichia coli Enhance Intestinal Inflammatory Response. PLoS Pathog 2013;9:e1003141

2011

Martinez-Medina M, Garcia-Gil J, Barnich N, Wieler LH, Ewers C. Adherent-Invasive Escherichia coli phenotype displayed by Intestinal Pathogenic E. coli Strains from cats, dogs, and swine. Applied and Envirnomental Microbiology 77(16): 5813–5817.

2009

Martinez-Medina M, Aldeguer X, Lopez-Siles M, González-Huix F, López-Oliu C, Dahbi G, Blanco JE, Blanco J, Garcia-Gil LJ, and Darfeuille-Michaud A. Molecular diversity of Escherichia coli in the human gut: new ecological evidence supporting the role of adherent-invasive E. coli (AIEC) in Crohn’s disease. Inflammatory Bowel Diseases 15(6):872-882

Martinez-Medina M, Mora A, Blanco M, Lopez C, Alonso MP, Bonacorsi S, Nicolas-Chanoine M-H, Darfeuille-Michaud A, Garcia-Gil J, and Blanco J. Similarity and divergence among Adherent-Invasive Escherichia coli and Extraintestinal Pathogenic E. coli strains. Journal of Clinical Microbiology 47(12):3968-3979

Martinez-Medina M, Naves P, Blanco J, Aldeguer X, Blanco J, Blanco M, Ponte C, Soriano F, Darfeuille-Michaud A, and Garcia-Gil LJ. Biofilm formation as a novel phenotypic feature of adherent-invasive Escherichia coli (AIEC). BMC Microbiology 9(1):202

Bañeras L, Gich F, Martinez-Medina M, Miller M, Abella CA, and Borrego CM. New phylotypes of mesophilic filamentous anoxygenic phototrophic bacteria enriched from sulfide-containing environments. Environmental Microbiology Reports (1): 86-93

2008

Darfeuille-Michaud A, and Colombel JF. Secció d’aquesta revisió: Martinez-Medina M, Lopez-Siles M, Aldeguer X, Gonzalez-Huix F, Lopez-Oliu C, Blanco J, Darfeuille-Michaud A, and Garcia-Gil LJ. Pathogenic Escherichia coli in inflammatory bowel diseases. Proceedings of the 1st International Meeting on E. coli and IBD, June 2007, Lille, France. Secció d’aquesta revisió: Presentation 6: Prevalence and diversity of adherent invasive E. coli in Crohn's disease patients from Girona, Spain. Journal of Crohn's and Colitis, 2: 259

2006

Martinez-Medina M, Aldeguer X, Gonzalez-Huix F, Acero D, and Garcia-Gil LJ. Abnormal microbiota composition in the ileocolonic mucosa of Crohn's disease patients as revealed by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis. Inflammatory Bowel Diseases 12(12):1136-1145


Estades en centres de recerca

Pre-doctorals

2005, durant 2 mesos: Veterinary Molecular Microbiology Pathogenesis Laboratory, University of Bristol, REGNE UNIT             

2006-2007, durant 4,5 mesos: Laboratoire de Pathogénie Bacteriénne Intestinale, Université d'Auvergne, FRANÇA

Post-doctoral

2010, durant 1 any i 4 mesos: Laboratoire de Pathogénie Bacteriénne Intestinale, Université d'Auvergne, FRANÇA

 

Direcció de tesis doctorals

Doctorand: Mireia López Siles. Títol: Ecophysiology and phylogeny of Faecalibacterium prausnitzii in healthy and diseased gut. Application in Inflammatory Bowel Disease diagnostics. Any: 2016

Directors: Jesús Garcia Gil i Margarita Martínez Medina. Institució: Universitat de Girona. 


Participacions més rellevants a congressos

Comunicacions orals

Carla Camprubí-Font, Mireia López-Siles, Meritxell Ferrer-Guixeras, Laura Niubo-Carulla, Carles Abellà-Ametller, Jesús Garcia-Gil, Margarita Martinez-Medina. Comparative genomics and single nucleotide polymorphism distribution between adhesrent-invasive Escherichia coli (AIEC) and non-AIEC strans from the human intestine. UEGW, Wien (Austria). 2016.

Martinez-Medina, M; E. coli and inflammatory bowel diseases . ESCMID Conference on Escherichia coli: An Old Friend with New Tidings., Barcelona (Spain). 2013. Invited talk

Martinez-Medina, M; Denizot, J; Darfeuille- Michaud, A; Barnich, N. High fat diet favours AIEC colonization and inflammation in CEABAC10 mice by modulating microflora composition. 15th International Conference on Mucosal Immunology, Paris (France). 2011. 

Martinez-Medina, M; Denizot, J; Darfeuille- Michaud, A; Barnich, N. High fat diet favours AIEC colonization and inflammation in CEABAC10 mice by modulating microflora composition. 8ème Rencontre des Microbiologistes du pôle Clermontois, Aubière (France). 2011.

Martinez-Medina, M; Garcia-Gil, M; Barnich, N; Wieler,L.H.; Ewers, C. Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC) – a group of pathogens associated with Crohn’s disease in humans – are frequently isolated from enteritis in cats, dogs, and swine. National Symposium on Zoonoses Research 2011, Berlin (GREMANY). 2011.

Martinez-Medina, M; Garcia-Gil, M; Barnich, N; Wieler,L.H.; Ewers, C. Animals as putative source of Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC) – a group of pathogens associated with Crohn’s disease in humans. 63rd Annual Meeting of the German Society for Hygiene and Microbiology (DGHM), Hamburg (GERMANY). 2011.

Martinez-Medina, M.; Aldeguer, X.; González-Huix, F.; Acero, D.; Blanco, J.; Garcia-Gil, L.J. Prevalence and diversity of AIEC in Crohn’s disease patients from Girona, Spain. 1st Workshop on Invasive E. coli and Crohn, Lille (France). Publicació: Journal of Crohn's and Colitis (2008) 2, 255–262. 2007. Invited talk      

Martínez-Medina, M.; Aldeguer, X.; González-Huix, F.; Garcia-Gil, L.J. High prevalence of Escherichia coli in intestinal mucosa of Crohn’s disease patients compared with healthy controls. First Conference on New Frontiers on Microbiology and Infections. Lessons from Escherichia coli: from basic research to clinical aspects, Villars-sur-Ollon (Switzerland). 2005.

Martínez-Medina, M.; Aldeguer, X.; González-Huix, F.; Garcia-Gil, L.J. Anàlisi molecular dels bacteris íntimament associats a la mucosa intestinal de malalts de Crohn. XIV Congrés de la Societat Catalana de Digestologia, Roses (Spain). 2004.

Martínez-Medina, M.; Aldeguer, X.; González-Huix, F.; Garcia-Gil, L.J. Diversidad molecular de las bacterias íntimamente asociadas a la mucosa intestinal: en busca de marcadores microbianos de la enfermedad de Crohn. XIV Reunión nacional del GETECCU, Madrid (Spain). 2004.

Martínez-Medina M, Garcia-Gil, J. Diversitat de microbià de la colònia de Sant Jordi (Mallorca). Jornades sobre ambients aquàtics microestratificats, València (Spain). 2003.

Pòsters premiats

Martinez-Medina, M; Denizot, J; Darfeuille- Michaud, A; Barnich, N.  7th Congress of ECCO, Barcelona (SPAIN). 2012. 'Higlhy Commended”

Martinez-Medina, M; Denizot, J; Darfeuille- Michaud, A; Barnich, N. Westernalized diet on CEABAC10 mice induces a specific dysbiosis with increased Escherichia coli, modulates innate immune gene expression and favors AIEC colonization promoting inflammation. Digestive Disease Week 2012, San Diego (USA). 2012. ‘Top Poster’

Martinez-Medina, M; Denizot, J; Billard, E; Darfeuille- Michaud, A; Barnich, N. High fat diet modulates gut microbiota composition, favors AIEC colonization and promotes inflammation in CEABAC10 mice. 19th United European Digestive Week, Stockholm (SWEDEN). 2011. ‘Top Poster’.

Martinez-Medina, M.; Naves, P.; Blanco, J.; Aldeguer, X.; Blanco, JE.; Blanco, M.; Ponte, C.; Soriano, F.; and Garcia-Gil, LJ. Biofilm formation of Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC): a novel phenotypic trait that could be related to AIEC pathogenesis. 4th Congress of ECCO, Hamburg (GERMANY). Publicació: Journal of Crohn's and Colitis, 3(1):S136-S136. 2009. “Higlhy Commended”.

Lopez-Siles, M.; Martinez-Medina, M.; Aldeguer, X.; Garcia-Gil, LJ. Mucosa-associated Escherichia coli and Faecalibacterium prausnitzii quantification by real-time PCR and its potential use as complementary diagnostic tool for inflammatory bowel diseases. 4th Congress of ECCO, Hamburg (GERMANY). Publicació: Journal of Crohn's and Colitis, 3(1):S135-S135. 2009. Poster of distinction”.


Beques i ajuts

Ajuts Complementaris per a la mobilitat d'Investigadors de la UdG 2005. Universitat de Girona.

Ajuts Complementaris per a la mobilitat d'Investigadors de la UdG 2006. Universitat de Girona. 

Ajuts per a Estades Breus d’Internacionalització del PDI de la Universitat de Girona 2010. Universitat de Girona.

Travel Grant for the United European Gastroenterology Week ‘UEGW’ 2011. The United European Gastroenterology Federation (UEGF) and the World Gastroenterology Organisation (WGO)

Travel Grant for the INRA-Rowett conference 2012. FEMS Travel grants.

Ajuts per a la publicació d’articles vinculats a tesis doctorals (Convocatòria 2008). Universitat de Girona.

Travel Grant for the United European Gastroenterology Week ‘UEGW’ 2016. The United European Gastroenterology Federation (UEGF) and the World Gastroenterology Organisation (WGO)


Docència impartida

Màster

Patogenicitat Microbiana. Fonaments Moleculars, Màster Universitari en Biologia molecular i Biomedicina

Bioinforàtica, Màster Universitari en Biologia molecular i Biomedicina

Elements per a una diagnosi de la qualitat dels sistemes aquàtics continentals, Màster de l'Aigua

Graus

Microbiologia Clínica, Quart curs, Grau de Biologia

Microbiologia, Segon curs, Graus de Biologia i Biotecnologia

Pràctiques de Microbiologia,  Segon curs, Grau de Biologia 

Introducció a l'estudi de la Medicina. Interacció amb agressors de l'entorn 1, Segon Curs, Grau de Medicina

Fonaments de bioinformàtica, Tercer curs, Graus de Biologia i Biotecnologia

Llicenciatura

Anàlisis microbiològiques, Tercer curs, Biologia

Pràctiques de biologia fonamental, Segon curs, Ciències Ambientals

Virologia, BIOLOGIA, Segon curs, Biologia