Tesi doctoral d'Anju Manickoth: "Growth of Eumelanin Precursors: Redox Chemistry, Kinetic Modelling and Photophysical Properties". Direcció: Dr. Lluís Blancafort San Jose
L'eumelanina
és el pigment negre-marronós present a la pell, els cabells i els ulls, i
destaca per la seva absorció de banda ampla en la regió UV-visible, la seva
fotoprotecció i la seva activitat redox. Malgrat haver estat àmpliament
estudiada, la seva estructura molecular i la seva formació continuen sent
difícils de definir perquè la biosíntesi implica intermediaris reactius,
diversos estats redox, vies de couplatge competidores i productes oligomèrics
heterogenis. En particular, l'oligomerització oxidativa de la
5,6-dihidroxiindole (DHI), un precursor clau de fase avançada, pot generar
espècies com ara la semiquinona (SQ(⋅)) i la indole-5,6-quinona (IQ). Comprendre'n la
reactivitat, el comportament àcid-base i redox, i la contribució a les
propietats òptiques és essencial per descriure molecularment la formació i la
funció de l'eumelanina.
Aquesta tesi
va utilitzar una estratègia computacional de baix a dalt per examinar tres
aspectes connectats de la química de l'eumelanina basada en DHI: la formació
inicial de dímers de DHI, la termodinàmica àcid-base i redox d'anàlegs
protegits de DHI, i l'efecte de la longitud de l'oligòmer sobre les propietats
fotofísiques.
La primera
part es va centrar en la dimerització oxidativa no enzimàtica del DHI. Les
energies lliures de reacció i d'activació calculades mitjançant DFT es van
convertir en constants de velocitat utilitzant la teoria de l'estat de
transició i es van incorporar en un model cinètic. Els resultats van mostrar
que la formació de dímers no està governada només per les barreres intrínseques
dels acoblaments C-C, sinó també per la disponibilitat, dependent del pH, dels
intermediaris reactius. A pH àcid i neutre, dominen les vies d'acoblament
basades en SQ(⋅),
que donen principalment dímers 2,7’ i 4,7’ En condicions bàsiques, la
distribució redox es desplaça cap a l'acoblament basat en IQ(⋅-), afavorint el dímer 4,4’.
Així, el pH actua com un interruptor químic que controla la regioselectivitat
mitjançant l'especiació redox.
Com que el
DHI i les seves formes oxidades són altament reactius, els estudis
experimentals sovint utilitzen derivats protegits. Per aquest motiu, la segona
part va examinar la termodinàmica àcid-base i redox del DHI protegit amb grups o-tolil
a les posicions C2, C4 i C7, així com de les
seves variants redox. El mètode híbrid QM/MM Perturbed Matrix Method (PMM) va
incloure explícitament el dissolvent i els contraions, mantenint una descripció
mecanicoquàntica de les espècies d'eumelanina. Després de l'optimització del
protocol, el PMM va reproduir el comportament redox dels compostos protegits
amb desviacions d'aproximadament 0,2-0,5 V respecte a l'experiment i va donar
suport a l'assignació dels pics de voltametria cíclica. Els càlculs també van
mostrar que la protecció generalment disminueix l'acidesa, augmentant els
valors de pKa aproximadament 2-4 unitats respecte a les espècies no
protegides corresponents.
La part final
va investigar com evolucionen les propietats òptiques dels oligòmers de DHI amb
la longitud de la cadena. Els càlculs TD-DFT sobre oligòmers de DHI O-acetilats
units per 2,7’, des del monòmer fins al pentàmer, amb suport experimental, van
mostrar que el desplaçament cap al vermell no augmenta indefinidament. La major
part del desplaçament té lloc durant les primeres etapes de l'oligomerització,
fins a aproximadament quatre unitats de DHI, després de les quals el perfil
d'absorció s'estabilitza en gran part. L'anàlisi d'orbitals naturals de
transició va mostrar que el parell electró-forat roman localitzat només sobre
una part de la cadena, en lloc d'estendre's per tot l'oligòmer. Aquesta
delocalització limitada de l'excitó s'origina per una combinació de
coplanaritat no ideal, estructura nodal desfavorable, densitat orbital reduïda
en alguns llocs d'acoblament i desajust energètic entre orbitals frontera
interactuants.
En conjunt,
aquesta tesi proporciona una descripció molecular de la química inicial de
l'eumelanina basada en DHI. Identifica les vies més favorables de formació de
dímers, explica com el pH controla la regioselectivitat mitjançant l'especiació
redox, quantifica el comportament àcid-base i redox de les espècies protegides
de DHI, i defineix fins a quin punt el creixement oligomèric modula l'absorció
òptica. En connectar vies de formació, termodinàmica i propietats d'estat
excitat, aquest treball estableix una base per estudiar oligòmers superiors i
estructures similars a l'eumelanina amb estats redox mixtos.
Lectura de la tesi: 28/07/2026 a l'Aula Magna de la Facultat de Ciències (informació extreta de l’Agenda activitats de la web Escola de Doctorat).