Anar al contingut (clic a Intro)
UdG Home UdG Home
Tancar
Menú

Estudia

Dades generals

Curs acadèmic:
2025
Descripció:
El disseny de proteïnes. Eines generals per a l'enginyeria de proteïnes. Disseny de novo i redisseny de proteïnes naturals. Aplicacions de l'enginyeria de proteïnes.
Crèdits ECTS:
3
Professor responsable:
Antoni Benito Mundet

Grups

Grup F

Durada:
Semestral, 1r semestre
Professorat:
Antoni Benito Mundet
Idioma de les classes:
Català (100%)

Competències

  • Capacitat per analitzar críticament a partir de la recollida d'informació i la interpretació de dades , situacions complexes i dissenyar estratègies creatives i innovadores per resoldre-les
  • Saber comunicar-se oralment i per escrit en l'àmbit científic i professional , utilitzant les llengües pròpies i l'anglès
  • Treballar en equip contribuint a l'elaboració de projectes específics i multidisciplinaris
  • Planificar i avaluar la pròpia activitat i el propi aprenentatge i elaborar estratègies per millorar-los aplicant criteris de qualitat
  • Capacitat per actuar, generar propostes i prendre decisions en la investigació i en l'activitat professional amb criteris ètics i de sostenibilitat
  • Utilitzar programes informàtics específics per al tractament complex de dades
  • Aplicar les principals tècniques , estratègies i metodologies per a l'estudi , utilització i millora de sistemes biològics , incloent els mètodes de cultiu cel·lular i DNA recombinant

Continguts

1. Nivells d’estructuració proteica. Estructura primària: els aminoàcids i l’enllaç peptídic. Principals elements d’estructura secundària. Estructura súper-secundària. Dominis. Estructura terciària. Estructura quaternària.

2. Plegament i desplegament de proteïnes: estat natiu i estat desplegat. Estabilitat i dinàmica conformacional. Models que descriuen el plegament proteic. Plegament i agregació: malalties conformacionals.

3. Tipus principals de modificacions post-traduccionals i implicacions funcionals. Degradació i recanvi proteic.

4. Desenvolupament inicial de l’enginyeria de proteïnes i principals estratègies. Enginyeria per disseny racional amb mutagènesi dirigida. Disseny semi-racional.

5. Enginyeria racional de proteïnes per fusió de dominis proteics o inserció de segments peptídics.

6. Enginyeria de proteïnes per evolució dirigida i enginyeria combinatòria. Estratègies de cribatge de genoteques de mutants i aplicacions

7. Predicció de l’estructura proteica. Redisseny i disseny ‘de novo’.

8. Enginyeria de proteïnes amb aminoàcids no-naturals: lligació de proteïnes, tall i unió de proteïnes i expansió del codi genètic.

9. Mètodes teòrics i computacionals per al modelat i el disseny de proteïnes. Bases de dades seqüencials i estructurals de proteïnes: PIR, SwissProt i Protein Data Bank.

Activitats

Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Hores virtuals amb professor Total
Anàlisi / estudi de casos 10,00 5,00 0 15,00
Elaboració individual de treballs 0 26,00 6,00 32,00
Prova d'avaluació 2,00 8,00 0 10,00
Seminaris 6,00 0 0 6,00
Sessió expositiva 7,00 5,00 0 12,00
Total 25,00 44,00 6,00 75

Bibliografia

  • Petsko, Ringe (2004). PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION. Wiley-Blackwell.
  • Whitford (2005). PROTEINS. STRUCTURE AND FUNCTION. Wiley-Blackwell.
  • Gómez-Moreno, Sancho (coordinadores) (2003). ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS. Ariel. Catàleg
  • Creighton (1993). PROTEINS. STRUCTURE AND MOLECULAR PROPERTIES. Freeman. Catàleg
  • Lijas et al (2009). . TEXTBOOK OF STRUCTURAL BIOLOGY. World Scientific Publishing.
  • Branden, Tooze (1999). INTRODUCTION TO PROTEIN STRUCTURE. Garland. Catàleg
  • Allan Fersht (1999). STRUCTURE AND MECHANISM IN PROTEIN SCIENCE. Freeman. Catàleg
  • Brakman and Johnsson (2002). DIRECTED MOLECULAR EVOLUTION. Wiley-VCH.

Avaluació i qualificació

Activitats d'avaluació:

Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat % Recuperable
A partir de la informació aportada pel professor en el seminari sobre visualització i modelat de proteïnes, s'haurà d'elaborar un treball sobre una proteïna en concret que reculli informació sobre l'estructura de la proteïna i les interaccions amb un lligand. El treball suposa un 20% de la nota final.
Es valorarà la presentació del treball dins la data fixada, la presentació i el fet que s'ajusti al format i la qualitat i el rigor del mateix. 20 No
A partir de la informació aportada pel professor en el seminari sobre bases de dades, s'haurà d'elaborar un treball sobre una proteïna en concret que reculli informació del PDB i altres bases de dades. El treball suposa un 20% de la nota final. Es valorarà la presentació del treball dins la data fixada, la presentació i el fet que s'ajusti al format i la qualitat i el rigor del mateix. 20 No
Prova d'avaluació escrita sobre els continguts que s'han treballat en l'assignatura. S'avaluaran els coneixements assolits en relació als continguts treballats en l'assignatura. Es superarà l'assignatura quan la suma de les diferents parts superi els 5.0 sobre 10. 60

Qualificació

Es superarà l'assignatura quan la suma de les diferents parts superi els 5.0 sobre 10 sempre i quant s'hagi obtingut una nota de l'examen final igual o superior a 4.

Si es detecta la realització fraudulenta (ús d'informació sense autorització, utilització d'informació falsa, utilització de dispositius no autoritzats, suplantació de la identitat, plagis totals o parcials, compra i venda de proves, pràctiques i treballs, etc) de qualsevol dels exercicis exigits en l’avaluació de l'assignatura, això comportarà la no superació de l’assignatura, amb independència del procés disciplinari que es pugui seguir contra l’estudiant infractor.

Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Es considerarà un no presentat quan l'estudiant no es presenti a la prova d'avaluació escrita i/o no entregui el treball.

Avaluació única:
Els estudiants que s'acullin a l'avaluació única hauran de realitzar únicament la prova d'avaluació escrita final la qualificació de la qual correspondrà al 100% de la nota. Aquesta prova és recuperable.

Requisits mínims per aprovar:
Per considerar superada l’assignatura caldrà obtenir una qualificació mínima de 4.0 de l'examen final i una qualificació mínima global de 5.0

Tutoria

Els estudiants i professors poden acordar una cita per a una reunió (individual o en grup reduït) a la hora i lloc adequats per a resoldre qualsevol tipus de dubte que no es pugui resoldre per correu electrònic.

Comunicació i interacció amb l'estudiantat

Les notificacions generals als estudiants es faran a través de la plataforma Moodle. La principal forma de comunicació entre professors i estudiants serà per correu.

Assignatures recomanades

  • Biologia molecular
  • Bioquímica
  • Experimentació en bioquímica
  • Pràctiques de biologia molecular
  • Pràctiques de Bioquímica

Escull quins tipus de galetes acceptes que el web de la Universitat de Girona pugui guardar en el teu navegador.

Les imprescindibles per facilitar la vostra connexió. No hi ha opció d'inhabilitar-les, atès que són les necessàries pel funcionament del lloc web.

Permeten recordar les vostres opcions (per exemple llengua o regió des de la qual accediu), per tal de proporcionar-vos serveis avançats.

Proporcionen informació estadística i permeten millorar els serveis. Utilitzem cookies de Google Analytics que podeu desactivar instal·lant-vos aquest plugin.

Per a oferir continguts publicitaris relacionats amb els interessos de l'usuari, bé directament, bé per mitjà de tercers (“adservers”). Cal activar-les si vols veure els vídeos de Youtube incrustats en el web de la Universitat de Girona.