En aquest àmbit s’estudien la variabilitat de les distribucions in situ de partícules inerts i de les poblacions planctòniques associades als fenòmens de barreja en sistemes naturals (embassaments i aiguamolls) i la seva variabilitat tant espacial com temporal. Aquesta línia inclou l’estudi de fenòmens com la dinàmica dels plomalls convectius carregats de partícules en un llac, l’efecte de les plantes submergides i emergents sobre la barreja i el transport en una columna d’aigua (efecte d’ombratge i protecció) i la dinàmica de poblacions d’algues lligades als fenòmens de barreja en llacs i embassaments. Al laboratori es simulen i es reprodueixen els principals fenòmens que es donen en els sistemes naturals. S’estudia l’efecte de les plantes sobre l’atenuació de les ones. Actualment les línies interdisciplinàries es desenvolupen amb molta intensitat en zones litorals i costaneres, en col•laboració amb empreses interessades en el tema. També es porten a terme treballs sobre la filtració biològica de l’aigua amb la finalitat de millorar les tècniques de depuració d’aigües residuals. En aquests treballs hi col•labora el Consorci de la Costa Brava.