CG3 - Capacitat per estructurar i transmetre oralment i per escrit coneixements i raonaments a diversos tipus de públic (expert i no expert), de forma clara, adecuada original i creativa. CG7 - Capacitat per realitzar treball pràctic de laboratori, formulant hipòtesis de treball, judicis i conclusions, per a la seva aplicació en el camp professional i per respondre als objectius d'una línia d'investigació. CE-2 - Planificar estratègies i triar les eines i les tècniques adequades per assolir un objectiu concret relacionat amb el disseny d'un experiment o el desenvolupament d'una aplicació en l'àmbit de la biotecnologia alimentària. CE-4 - Saber aplicar les tècniques d'anàlisi bioquímic, microbiològic, molecular i cel · lular, i les eines bioinformàtiques necessàries per a l'exercici professional en l'àmbit de la biotecnologia.
1. Introducció general a la bioinformàtica 2. Dades genòmiques. 2.1. Bases de dades i formats de dades 2.2. Motors de cerca. Gens, genomes, altres 3. Anàlisi de seqüències. Alineaments: teoria i pràctica. 4. Genòmica i trancriptòmica 4.1. Predicció gènica i reconeixement de factors de transcripció 4.2. Anàlisi a escala de genoma. Next generation sequencing
Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Hores virtuals amb professor Total Elaboració individual de treballs 2,00 20,00 0 22,00 Exposició dels estudiants 3,00 10,00 0 13,00 Prova d'avaluació 3,00 5,00 0 8,00 Sessió pràctica 20,00 10,00 0 30,00 Total 28,00 45,00 0 73
Basic Local Alignment Search Tool. Recuperat , a http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast& ClustalW2. Recuperat , a http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/ MOLECULAR EVOLUTIONARY GENETICS ANALYSIS MEGA 5. Recuperat , a http://www.megasoftware.net/ Chromas Lite 2.1.1 (free). Recuperat , a http://technelysium.com.au/
Activitats d'avaluació: Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat % Recuperable Pràctiques d'aula bioinformàtica Realització dels exercicis proposats de forma correcta. 10 No Elaboració de treballs Estructuració, claredat, correcció en les eines utilitzades i en les solucions proposades. 25 No Exposició de treballs en grup. Capacitat de comunicar els coneixements oralment i de interpretar i analitzar la informació obtinguda. 25 No Exercicis d'avaluació Ús correcte de les eines bioinformàtiques. Interpretació dels resultats obtinguts. Correcció en la solució aportada. 40 No
Assistència a les pràctiques d'aula obligatòria. Realització de tots els treballs i activitats proposades. Per aprovar cal realitzar totes les activitats d'avaluació proposades i obtenir un mínim de 5/10 en la nota global de l'assignatura. Criteris específics de la nota «No Presentat»:No assistència a les activitats presencials d'avaluació. No presentació dels exercicis i proves d'avaluació. Avaluació única:L'avaluació única consistirà en un EXAMEN FINAL recuperable que inclourà qüestions sobre els continguts desenvolupats a les classes de teoria i pràctiques d'aula Requisits mínims per aprovar:Per considerar superada l’assignatura, caldrà obtenir una qualificació mínima de 5.0
Les tutories es podran fer presencials o a través de videoconferència. Els estudiants hauran de sol·licitar cita prèvia per correu electrònic institucional i acordar l'hora de la reunió amb el professor amb el qual es vulgui concertar la tutoria. S'utilitzaran els mateixos procediments quan els professors vulguin convocar a algun estudiant o grup d'estudiants a una sessió de tutoria.
En totes les activitats programades amb professor presencial hi haurà interacció amb l'estudiant. La plataforma Moodle serà l'espai que s'utilitzarà per: - posar a l'abast dels estudiants les presentacions dels continguts que s'imparteixin i els altres materials de suport. - proposar i rebre treballs i exercicis, a través de les tasques i altres eines de la plataforma. - publicar els resultats de les proves d'avaluació, a través del qualificador. - comunicar i rebre consultes sobre aspectes d'organització de l'assignatura, a través del forum d’avisos i notícies. L'ús del correu electrònic institucional es considera adequat per la comunicació i per concertar tutories (individuals o en grups reduïts) amb els professors.