Estudia

• 1. Identificar problemes, buscar solucions originals i aplicar-les en un context d'investigació o professional
• 4. Comunicar de forma clara i concisa els seus coneixements, les seves conclusions i les implicacions ètiques i socials del seu camp de treball a públics especialitzats i no especialitzats ( divulgació científica)
• 5. Actualitzar i prosseguir els seus estudis de forma auto-dirigida i autònoma, recollint i seleccionant la informació necessària que permeti una investigació original i que aporti nous coneixements
• 8. integrar els aspectes metodològics i els continguts de les diferents disciplines de les biociències per al seu estudi a nivell molecular
• 11. Identificar i analitzar els mecanismes moleculars bàsics que operen en els éssers vius, particularment l'home, així com les seves aplicacions en diferents camps d'investigació
• 12. Gestionar i planificar l'ús racional de tècniques freqüents en Biología Molecular en noves situacions d'estudi o experimentació
• 13. Avaluar l'ús i la necessitat de tècniques avançades en biología molecular així com la seva adaptació a necessitats particulars requerides
• 15. Valorar la utilitat de tècniques de modificació genètica d'organismes per a estudis i tractament de patologies humanes, la millora de processos i productes biotecnològics
• 17. Identificar i generar solucions a problemes plantejats en els àmbits de la Biomediciona Molecular i la Patologia Molecular

1. Genòmica funcional: genètica inversa (del gen al fenotip). Editat de gens: Zn finger nucleases, Talen, CRISPR/Cas, prime editing. ////////////////////////////////////////////////////////////////// Functional genomics: reverse genetics (from gene to phenotype). Gene editing: Zn finger nuclease, Talen, CRISPR/Cas, prime editing.

2. Genòmica funcional: CRISPR-Cas, més enllà de produir un doble tall per a l'edició gènica. ////////////////////////////////////////////////////////////////// Functional genomics: CRISPR-Cas, beyond DNA break for gene editing.

3. -Omics a nivell cel·lular: transcriptoma i traduccionoma per conèixer per apropar-nos a la funció cel·lular /////////////////////////////////// -Omics at cellular level: transcriptomics and translatomics to understand the cell function.

4. Aspectes pràctics de l’obtenció d’organismes modificats genèticament: disseny dels vectors recombinants, selecció de vectors, estratègies de clonació (enzims de restricció i sistema Gateway), validació de resultats, cerques en bases de dades. /////////////////////////////////////////////////////////////////////// Practical aspects for genetically modified organisms obtaining: recombinant vector design, vector selection, cloning strategies (restriction enzymes and Gateway system), results validation, Database search.

5. Aspectes pràctics del sistema CRISPR/Cas com a estratègia prometedora per edició genètica en organismes. /////////////////////////////////////////////////////////// Practical aspects of CRISPR/Cas system as a promising strategy for gene editing in organism.

• Mackosko et al. (2015). Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanol. Cell, 21(161), 1202-1214. Recuperat , a https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.05.002
• Haber et al. (2017). A single-cell survey of the small intestinal epithelium. . Nature, 551(), 333-339. Recuperat , a https://doi.org/10.1038/nature24489
• Liao et al. (2021). Uncovering an Organ’s Molecular Architecture at Single-Cell Resolution by Spatia. Trends in Biotechnology,, 43-58. Recuperat , a https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2020.05.006
• Han et al. (2018). Proximity labelling: spatially resolved proteomic mapping for neurobiology. Current Opinion in Neurobiology, 50(), 17-23. Recuperat , a https://doi.org/10.1016/j.conb.2017.10.015
• Branon et al. (2018). Efficient proximity labeling in living cells and organisms with TurboID. Nature Biotechnology, 36(), 880-887. Recuperat , a https://doi.org/10.1038/nbt.4201
• Brady et al. (2007). A high-resolution root spatiotemporal map reveals dominant expression patterns. Science, 318(), 801-806. Recuperat , a https://doi.org/10.1126/science.1146265
• Fox et al. (2007). The embryonic muscle transcriptome of Caenorhabditis elegans. . Genome Biology, 8, R188(), . Recuperat , a http://dx.doi.org/10.1186/gb-2007-8-9-r188
• Deal and Henikoff (2010). A simple method for gene expression and chromatin profiling of individual cell t. Developmental Cell, 18(), 1030-1040. Recuperat , a https://doi.org/10.1016/j.devcel.2010.05.013
• Hwang et al (2018). Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines. Experimental Molecular Medicine, 50(), . Recuperat , a https://doi.org/10.1038/s12276-018-0071-8
• Luecken and Theis (2019). Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial. Molecular Systems Biology, 15: e8746(), . Recuperat , a https://doi.org/10.15252/msb.20188746
• Pickar-Oliver and Gersbach (2019). The next generation of CRISR-Cas technologies and applications. Nature Reviews: Molecular Cell Biology,, . Recuperat , a https://doi.org/10.1038/s41580-019-0131-5
• Shalem et al (2015). High-throughput functional genomics using CRISPR-Cas9. Nature Reviews: Genetics,, . Recuperat , a https://doi.org/10.1038/nrg3899
• Katzen (2007). Gateway(®) recombinational cloning: a biological operating system. Expert Opinion on Drug Discovery,, . Recuperat , a https://doi.org/10.1517/17460441.2.4.571
• Durai et al. (2005). Zinc finger nucleases: custom-designed molecular scissors for genome engineering. Nucleic acids research, 33(18)(), 5978-90. Recuperat , a https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16251401/
• Mak et al., (2012). The Crystal Structure of TAL Effector PthXo1 Bound to Its DNA Target. Science, 335(6069)(), 716-9. Recuperat , a https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22223736/
• Mali et al (2013). RNA-Guided Human Genome Engineering via Cas9. Science, 339(6121)(), 823-6. Recuperat , a https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23287722/
• Alonso et al (2006). Moving forward in reverse: genetic technologies to enable genome-wide phenomic s. Nature Reviews Genetics, 7(), 524-536. Recuperat , a https://www.nature.com/articles/nrg1893
• Le Cong et al., (2013). Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems. Science, 339(6121)(), 819-23. Recuperat , a https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23287718/
• Jinek et al (2012). A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science, 337(6096)(), 816-21. Recuperat , a https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22745249/
• Anzalone et al (2019). Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA. Nature, 576(), 149-157. Recuperat , a https://www.nature.com/articles/s41586-019-1711-4

Activitats d'avaluació:

Perquè l’alumne pugui avaluar-se de l’assignatura cal haver assistit en un mínim del 80% de les classes. Només en cas de força major s’acceptarà una assistència a les classes menor del 80%. Aquesta causa de força major haurà d’estar degudament justificada.
L’entrega d’alguna de les activitats avaluables fora de termini i sense causa justificada, implicarà una reducció de la nota final d’aquella activitat: (10%, un dia de retràs, 30% dos dies de retràs). A partir del tercer dia aquesta activitat valdrà 0)
////////////////////////////////////////////////////
The student will be evaluated only if the attendance is higher or equal to 80%. The assistance lower than 80% will be only allowed when its caused by force majeure, which must be properly justified.
Delivery of any of the activities after the deadline, without justified cause, will reduce the final mark of this activity: 10% one day after deadline, 30% two days after deadline. When delivery is 3 days after deadline, the mark of this evaluation activity will be rate to 0.

Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Es considerarà no presentat quan l’estudiant no hagi assistit al 80% de les classes ni s'hagi avaluat de cap activitat.
///////////////////////////////////////////////////////// The student that will not attend to the 80% of the sessions nor has been evaluated of any activity will be considered as a non-presented student.

Avaluació única:
L’avaluació única consistirà en una presentació oral i un qüestionari sobre la comprensió dels articles presentats pels companys. Per adquirir les competències de l'assignatura de manera completa es requerirà assistir al 80% de les sessions organitzades durant les dues primeres setmanes de les 3 que dura l’assignatura, les quals són les sessions conduïdes pel professorat.

//////////////////////////////////////////////////////////////////////
The single evaluation will consist on an oral presentation and a test to check the comprehension of the papers presented by the schoolmates. This test will be performed taking into account the scientific papers, it will not be necessary to attend the presentation of the schoolmates. Hence the evaluation will be performed in a single day. To achieve the competences of the subject it is required to attend the 80% of the sessions performed during the two first weeks (conducted by the professors).

Requisits mínims per aprovar:
Per considerar superada l’assignatura, caldrà obtenir una qualificació mínima de 5.0 ///////////////////////////////
The qualification to pass the subject, a minimum of 5/10 will be required.

Es realitzaran tutories sota petició de l'estudiant via correu electrònic.
//////////////////////////////////
The students will be attended personally upon appointment by email.

La comunicació amb els estudiants serà preferentment a través del Fòrum de Notícies del Moodle, però també via email.
/////////////////////////////////////////////////////
The comunication with the students will be preferentially done by the Forum de Notícies from Moodle, but also via email.