Dades generals
-
Curs acadèmic:
- 2021
-
Descripció:
- Bases de dades biològiques. Data mining en biologia molecular i medicina. Programari habitual en biologia molecular i biomedicina.
-
Crèdits:
- 3
Grups
Grup A
-
Durada:
- Semestral, 1r semestre
-
Professorat:
- Alba Abras Feliu
/ Rosa Maria Araguas Solà
/ Sandra Heras Mena
/ Nuria Sanz Ball-llosera
-
Idioma de les classes:
- Català (50%), Castellà (50%)
Competències
- 1. Identificar problemes, buscar solucions originals i aplicar-les en un context d'investigació o professional
- 3. Formular judicis sobre la problemàtica ètica i social, actual i futura, que plantegen les ciències biotecnològiques en general i les biomèdiques en particular
- 4. Comunicar de forma clara i concisa els seus coneixements, les seves conclusions i les implicacions ètiques i socials del seu camp de treball a públics especialitzats i no especialitzats ( divulgació científica)
- 5. Actualitzar i prosseguir els seus estudis de forma auto-dirigida i autònoma, recollint i seleccionant la informació necessària que permeti una investigació original i que aporti nous coneixements
- 6. Elaborar propostes alternatives creatives en relació amb els objectius d'investigació, valorant en el seu cas les incerteses i riscos
- 8. integrar els aspectes metodològics i els continguts de les diferents disciplines de les biociències per al seu estudi a nivell molecular
- 13. Avaluar l'ús i la necessitat de tècniques avançades en biología molecular així com la seva adaptació a necessitats particulars requerides
- 16. Identificar i utilitzar racionalment les eines bio-informàtiques bàsiques ( bases de dades i programes d'anàlisis molecular) per contribuir al coneixement genòmic, transcriptòmic i proteòmic
Continguts
1. General introduction to bioinformatics
2. Introduction to bioinformatics utilities (Unix, R, R markdown and Galaxy)
3. usage in an example the bioinformatics utilities
4. Genome servers
5. Student assigment
Activitats
| Tipus d’activitat |
Hores amb professor |
Hores sense professor |
Hores virtuals amb professor |
Total |
| Anàlisi / estudi de casos |
10,00 |
35,00 |
0
|
45,00 |
| Sessió participativa |
20,00 |
10,00 |
0
|
30,00 |
| Total |
30,00 |
45,00 |
0
|
75 |
Bibliografia
- Buffalo, V. (2015). Bioinformatics data skills: Reproducible and robust research with open source tools. . " O'Reilly Media, Inc".
- Wickham, H., & Grolemund, G. (2016). R for data science: import, tidy, transform, visualize, and model data. . O'Reilly Media, Inc..
Avaluació i qualificació
Activitats d'avaluació:
| Descripció de l'activitat |
Avaluació de l'activitat |
% |
Recuperable |
| Resolució de problemes/Resolución de problemas |
S'avaluarà tant la resolució dels problemes a l'aula com exercicis que el professor pot proposar per resoldre a casa./Se evaluará tanto la resolución de los problemas en el aula como ejercicios que el profesor puede proponer para resolver en casa. |
40 |
Sí |
| Treball escrit: Resolució d'un cas / Trabajo escrito: Resolución de un caso |
S'avalua el treball entregat./Se evalua el trabajo entregado |
60 |
Sí |
Qualificació
La nota de l'assignatura prové de la resolució d'exercicis (a l'aula o a casa, que s'hauran d'entregar) i d'un treball plantejat pel professor, que caldrà entregar al final de l'assignatura./
La nota de la asignatura proviene de la resolución de ejercicios (en el aula o en casa, que se deberán entregar) y de un trabajo planteado por el profesor, que habrá que entregar al final de la asignatura
Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Es considerarà no presentat l'alumne que no presenti cap dels treballs que el professor demani s'han de presentar./Se considerará no presentado el alumno que no presente ninguno de los trabajos que el profesor pida deben presentarse.
Avaluació única:
L'avaluació única la podran seguir els alumnes que la facultat autoritizi i constarà d'un examen que inclourà els continguts de teoria i les presentacions de la resta d'alumnes.
La evaluación única la podran seguir los alumnos que la facultat autorize i constará de un examen sobre los contenidos de teoría y las presentaciones del resto de alumnos.
Requisits mínims per aprovar:
Per considerar superada l’assignatura, caldrà obtenir una qualificació mínima de 5.0
Tutoria
Les tutories seran a hores convingudes, cal pactar-les amb el professor per correu electrònic.
Las tutorias seran en horas convenidas, hace falta pactarlas con el profesor por correo electrónico.
Comunicacio i interacció amb l'estudiantat
La comunicació fora de l'aula serà per correu electrònic.
La comunicación fora del aula será por correo electrónico.
Modificació del disseny
Modificació de les activitats:
Escenari semipresencial
En el cas d’aforament limitat o modificacions horàries es permetrà el seguiment de les classes de forma telemàtica, amb streaming o presentacions amb narració. Si no n'hi ha, totes les sessions seran presencials, incloent-hi les d'avaluació.
Escenari tancament UdG
Les presentacions de les classes teòriques es realitzaran en streaming, en alguns caos es gravaran i penjaran en format pdf, ppt (amb gravació de veu) o mp4. Els professors posaran a l’abast dels estudiants a través del Moodle, el material addicional que consideri necessari per facilitar la comprensió i el seguiment de forma no presencial. Es programaran sessions de dubtes a través de la plataforma Google Meet. Les presentacions es realitzaran a través de Google Meet.
Tractament d'estudiants vulnerables o amb confinament temporal
Els estudiants vulnerables o en confinament podran seguir les sessions en streaming i fer les activitats d'avaluació online (incloent-hi les presentacions).
Escenario semipresencial
Si no hay limitación de aforo, todas las sesiones seran presenciales.
Escenario de cierre de la UdG
Las presentaciones de las clases teóricas se realizarán en streaming telemáticamente, en algunos casos se gravaran y colgaran. Habrá sesiones de dudas con Google Meet.
Estudiantes vulnerables o en confinamiento temporal
Los estudiantes vulnerables o en confinamiento podran seguir las sesiones en streaming.
Modificació de l'avaluació:
Escenari semipresencial
Les presentacions de treballs al llarg del decurs de l’assignatura no es modifica ja que es feia per Moodle. La presentació del treball final serà presencial.
Escenari tancament UdG
Les presentacions de treballs al llarg del decurs de l’assignatura no es modifica ja que es feia per Moodle. La presentació del treball es realitzarà a través de Google Meet al mateix dia i hora prèviament programats
Tractament d'estudiants vulnerables o amb confinament temporal
Les presentacions de treballs al llarg del decurs de l’assignatura no es modifica ja que es feia per Moodle. La presentació del treball es realitzarà a través de Google Meet al mateix dia i hora prèviament programats
Escenario semipresencial
Las presentaciones de trabajos durante la asignatura no se modifican ya que se realiza mediante las herramientas del Moodle. La presentación del trabajo final será presencial.
Escenario cierre UdG
Las presentaciones de trabajos durante la asignatura no se modifican ya que se realiza mediante las herramientas del Moodle. La presentación del trabajo final será mediante el Google Meet.
Estudiantes vulnerables o en confinamiento temporal
Las presentaciones de trabajos durante la asignatura no se modifican ya que se realiza mediante las herramientas del Moodle. La presentación del trabajo final será mediante el Google Meet.
Tutoria i comunicació:
Escenari semipresencial.
Les tutories es duran a terme a hores convingudes amb el professor, preferiblement amb Google Meet.
Escenari tancament UdG.
Les tutories es duran a terme mitjançant Google Meet, a hores convingudes amb el professor.
Tractament d'estudiants vulnerables o amb confinament temporal.
Les tutories es duran a terme mitjançant Google Meet, a hores convingudes amb el professor.
Escenario semipresencial.
Las tutorías se llevaran a cabo mediante cita previa con el profesor, preferentemente en Google Meet.
Escenario cierre UdG.
Las tutorías se llevaran a cabo mediante cita previa con el profesor, en Google Meet.
Estudiantes vulnerables o en confinamiento temporal.
Las tutorías se llevaran a cabo mediante cita previa con el profesor, en Google Meet.