La Menció de Qualitat constitueix una exigència derivada de la cada vegada major interacció dels sistemes universitaris nacionals a l'Espai Europeu d'Ensenyament Superior, per la qual cosa s'inscriu en les polítiques de qualitat del nostre sistema universitari que es preveuen expressament en la Llei Orgànica de Universitats.
L'obtenció de la Menció de qualitat s’otorga després d’un procés d’avaluació de l’ANECA i suposa un reconeixement de la solvència cientificotècnica i formadora del programa de Doctorat, així com dels grups o departaments que participen en el programa, que té com a repercussió immediata la captació d'estudiants de doctorat i l'obtenció de recursos.
A més, aquesta Menció de Qualitat permet demanar ajudes de l’administració vinculades a la mobilitat de professors i per a despeses associades al desenvolupament dels programes de doctorat i ajuda per a la mobilitat d'alumnes.
En la convocatòria 2010-11 tres dels programes de doctorat de la Universiat de Girona van obtenir la Menció de Qualitat: 
En la convocatòria 2008-09 quatre dels programes de doctorat de la Universitat de Girona van obternir la Menció de Qualitat:
- Programa de Doctorat en Ciències Experimentals i Sostenibilitat (MCD2006-00407)
- Programa de Doctorat en Ciències Humanes i de la Cultura (MCD2006-00048)
- Programa de Doctorat en Tecnologia (Informàtica, Automàtica, Agroalimentària, Tèxtil i Paperera, Materials i Estructures, Polímers i Innovació) (MCD2006-00405)
- Programa de Doctorat en Turisme, Dret i Empresa (MCD2006-00459)