La actividad de investigación en la Universidad de Girona se lleva a cabo a través de 20 departamentos, 8 institutos y 12 cátedras de investigación, de estructuras técnicas como observatorios y laboratorios, y de más de un centenar de grupos de investigación especializados según ámbitos de conocimiento (científico, tecnológico, humanístico o de las ciencias sociales).

La UdG también cuenta con los Servicios Técnicos de Investigación, campus especializados en investigación aplicada y una biblioteca con diferentes sedes y unidades. A través de la Oficina de Investigación y Transferencia Tecnológica y del Conocimiento, la UdG gestiona las ayudas y la difusión y concreción de la investigación en la sociedad.

El Parque Científico y Tecnológico es donde se concreta físicamente esta colaboración y transferencia tecnológica.

La Universidad de Girona promueve la formación de investigadores a través de un plan de becas propio que complementa los planes de becas de la Generalitat de Cataluña y de la Administración estatal. La organización de la investigación vela, asimismo, por conseguir una investigación de excelencia y la internacionalización.