| Convenis / Contractes |
| Any | Títol | Investigador responsable | Entitat finançadora |
| 2008-2011 | Clorofilas como indicador biológico en la cuenca del Ebro. Convenio Específico de colaboración UdG-CHE | Sergi Sabater | Confederación Hidrográfica del Ebro |
| 2010-2011 | Revisión taxonómica de catálogo de diatomeas de aguas continentales | Sergi Sabater | TRAGSATEC |
| 2010-2011 | Intercalibración de los índices de diatomeas de la región mediterránea europea. CTN1000636 | Sergi Sabater | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) |
| 2010-2013 | Seguimiento científico en el marco del proyecto LIFE-NATURALEZA: Recuperación de hábitats riparios del río Ter (Riparia-Ter), ref. LIFE08 NAT/E/000072. | Xavier Quintana | Consorci Alba Ter |
| 2008-2009 | Seguiment de l'efecte de la sequera sobre l'estat ecològic dels rius Ter, Fluvià i Muga durant l'any 2008. Clau:CTN0801757. | Emili García-Berthou | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) |
| 2008 | Anàlisi del impacte de l’arribada d’aigua potable des del sistema CAT a l’embassament de Riudecanyes | Sergi Sabater | Consorci Aigües de Tarragona |
| 2008 | Anàlisi del impacte de l’arribada d’aigua potable des del sistema CAT a l’embassament de Gaià | Sergi Sabater | Consorci Aigües de Tarragona |
| 2007-2009 | Avaluació de l'estat ecològic de les zones humides de Catalunya i ajustament i intercalibració dels indicadors de qualitat. | Dani Boix i Masafret | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) |
| 2007-2009 | Estudi de la diversitat d'invertebrats aquàtics presents en les basses temporals de Menorca en el marc del projecte LIFE-Naturaleza (LIFE05NAT/ES/000058): Conservació i gestió de basses temporals mediterrànies. | Dani Boix i Masafret | Consell Insular de Menorca |
| 2006-2009 | Conveni de col·laboració entre l'Agència Catalana de l'Aigua, la Fundació Bosch i Gimpera, les Universitats de Barcelona, Girona i LLeida, i l'Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries per ajustar l'índex d'integritat biòtica (Ibicat) basat en l'ús dels peixos com a indicadors de la qualitat ambiental als rius de Catalunya i intercalibrar-lo a nivell europeu tal com preveu la Directiva marc de l'aigua (2000/60/CE). | Emili García-Berthou | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) |
| 2006-2008 | Observatorio de la Tordera (estación de seguimiento de la biodiversidad de la cuenca de la Tordera). | Martí Boada (UAB) Emili García-Berthou (resp.línea Ictiofauna) | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) i Ajuntament de Sant Celoni |
| 2006-07 | Proyecto de restauración ambiental de los ecosistemas costeros de la Pletera en l’Estartit. TM Torroella de Montgrí (Girona) | Xavier Quintana | Ministerio de Medio Ambiente. Dirección General de Costas |
| 2007 | Estudio de la funcionalidad del pico- y nanoplancton a lo largo del gradiente trófico y de salinidad en lagunas costeras mediterráneas | Xavier Quintana | Estación Biológica de Doñana (CSIC) |
| 2007 | Prospección de branquiópodos (Crustacea) en las lagunas de la Reserva Biológica de Doñana. | Dani Boix i Masafret | Estación Biológica de Doñana (CSIC) |
| 2008 | Contracte amb Ibérica de Estudios e Ingeniería (IBERINSA) per Estudi dels peixos de l'embassament de Sau durant 2007 i 2008. | Emili García-Berthou | Agència Catalana de l'Aigua (Generaliltat de Catalunya) & Ibérica de Estudios e Ingeniería (IBERINSA) |
| 2008 | Determinación de la disponibilidad trófica para el fartet en el área de actuación del proyecto LIFE NAT/ES/000035. | Stéphanie Gascón Garcia | Universidad de Murcia |
| 2008 | Seguimiento de características físicas y químicas del agua en el área de actuación del proyecto LIFE NAT/ES/000035. | Xavier Quintana i Pou | Universidad de Murcia |
| 2007 | Anàlisis de la concentració de nutrients i clorofil·la de les zones humides del nord-est de Catalunya. | Dani Boix i Masafret | Agència Catalana de l'Aigua (Generalitat de Catalunya) |
| 2006 | Avaluació de la qualiltat de l'aigua en diferents trams del Riuet, al Parc Natural dels Aiguamolls de l'Empordà, a partir dels invertebrats aquàtics. | Xavier Quintana i Pou | Parc Natural dels Aiguamolls de l'Empordà |
| 2005-07 | Estudio de las dinámicas de las poblaciones de peces en el río Ebro entre el embalse de Ribarroja y la desembocadura | Emili Garcia | Ministeri de Medi Ambient i Agència Catalana de l'Aigua |
| 2005-06 | Contractació per a l’estudi dels peixos durant el buidat de l’embassament de Sau | Emili Garcia | Agència Catalana de l'Aigua i Generalitat de Catalunya |
| 2004-06 | Seguimiento y propuestas para la minimización del impacto ambiental en las actuaciones del proyecto “Restauración ambiental y accesibilidad a la costa en la zona de Radio Liberty” | Xavier Quintana | Ministerio de Medio Ambiente. Dirección General de Costas |
| 2004-06 | Seguimiento científico del proyecto LIFE-Naturaleza: Restauración de los ambientes acuáticos de Porqueres y de Banyoles. Ref.: LIFE03 NAT/E/000067 | Ramon Moreno, Dani Boix i Lluís Vilar | Consorci de l'Estany |
| 2004-06 | Evaluación de la calidad del agua en diferentes sectores de los Aiguamolls de l’Alt Empordà a partir de invertebrados acuáticos | Xavier Quintana | Parc Natural dels Aiguamolls de l'Alt Empordà |
| 2004-06 | Estudio de la comunidad acuática en una laguna de nueva creación en ‘els estanys de Jordà’ | Dani Boix | Parc Natural de la Zona Volcànica de la Garrotxa |
| 2003-05 | Contracte de col.laboració científica entre la Universitat de Girona i el Consorci de Medi Ambient i Salut Pública de la Garrotxa (SIGMA) | Helena Guasch | Laboratori comarcal de la Garrotxa (SIGMA) |
| 2003-06 | Observatori de la Tordera: línia d'ictiofauna | Emili Garcia | Agència Catalana de l'Aigua i Ajuntament de Sant Celoni |
| 2002-03 | Contracte del servei de caracterització, regionalització i elaboració d'eines d'establiment de l'estat ecològic de les zones humides de Catalunya tal i com contempla la directiva marc de l'aigua 2000/60/EC | Xavier Quintana, Dani Boix i Ramon Moreno | Agència Catalana de l'Aigua. Generalitat de Catalunya |
| 2002-03 | Contracte del servei de caracterització de la comunitat íctia dels embassaments a Catalunya com a element per a l'elaboració d'eines d'establiment del potencial ecològic tal i com contempla la directiva marc de l'aigua (2000/60/EC) | Emili Garcia i Ramon Moreno | Agència Catalana de l'Aigua. Generalitat de Catalunya |
| 2002-03 | Conveni de col.laboració per a desenvolupar i testar la viabilitat d'un índex basat en la comunitat fitobentònica dels cursos fluvials a Catalunya | Sergi Sabater | Agència Catalana de l'Aigua. Generalitat de Catalunya |
| 2001 | Informe sobre la delimitació del domini públic marítim-terrestre de la Pletera (L'Estartit) | Xavier Quintana | Ministeri de Medi Ambient |
| 1999-2001 | Contracte de col.laboració científica entre la Universitat de Girona i el Servei de Control de Mosquits de Roses i el Baix Ter | Xavier Quintana | Servei de Control de Mosquits de Roses i el Baix Ter |