Las salidas profesionales son muy amplias, porque cada vez más la cromatografía está presente en más laboratorios, no tan sólo analíticos sino también biomédicos. Las industrias donde hay demanda de especialistas son principalmente las alimenticias, las farmacéuticas, las veterinarias, las petroquímicas y las químicas. Además, haber que mencionar los laboratorios de control sanitario, de control ambiental y de control forense, y muchos laboratorios de investigación, tanto los propiamente analíticos como los de apoyo a grupos de investigación químicos, bioquímicos, médicos, etc. La formación adquirida durante el máster capacita a los alumnos para alcanzar altos niveles de responsabilidad en cualquiera de los ámbitos mencionados.