El TFM se puede presentar en alguna de estas tres modalidades:
A. Trabajo de investigación
En esta modalidad se pretende que el estudiante realice una investigación empírica que tendrá que delimitar, diseñar y llevar a cabo. En el caso de investigaciones que, por su alcance, no puedan desarrollarse de manera completa, se aceptará un estudio piloto o un planteamiento completo.
Esta modalidad puede tomar la forma de revisión teórico-científica, cuyo objetivo será investigar sobre el estado actual de un tema o problemática relacionado con la psicología clínica o general sanitario.
B. Trabajo de innovación profesional
En esta modalidad, el objetivo es que el estudiante pueda desarrollar o intervenir en un nuevo diseño de programa de tratamiento que presente una innovación o variante sea por la aplicación a un nuevo colectivo, por la ampliación o rediseño del protocolo, por los instrumentos de evaluación implicados, por el contenido y diseño de las sesiones del programa o por la creación de materiales terapéuticos. Puede también ofrecerse como un programa complementario a una intervención terapéutica.
C. Trabajo de casos clínicos
Desde el punto de vista de la Psicología General Sanitaria, los estudios de casos son una metodología de gran utilidad, ya que permiten que los psicólogos puedan analizar y transmitir de una manera sistemática la vinculación entre los conocimientos teóricos y prácticos aplicados. En esta modalidad el estudiante tiene que analizar en profundidad un mínimo de 3 casos clínicos en los que haya intervenido directamente o que haya podido observar en su estancia de prácticas.