Dades generals

Curs acadèmic:
2013
Descripció:
Estructura i composició de les partícules virals. Origen in filogènia. Cicle viral i regulació lisis/lisogènia. Ecologia i patogènia viral. Diagnòstic, profilaxis i terapèutica. Mètodes de cultiu i quantificació dels virus.
Crèdits ECTS:
3
Idioma principal de les classes:
Anglès
S’utilitza oralment la llengua anglesa en l'assignatura:
Completament (100%)
S’utilitzen documents en llengua anglesa:
Completament (100%)

Grups

Grup BT

Durada:
Semestral, 2n semestre
Professorat:
LUIS BAÑERAS VIVES  / CARLES BORREGO MORE  / MIREIA LOPEZ SILES  / XAVIER TRIADO MARGARIT

Grup RA

Durada:
Semestral, 2n semestre
Professorat:
LUIS BAÑERAS VIVES  / CARLES BORREGO MORE  / MIREIA LOPEZ SILES  / XAVIER TRIADO MARGARIT

Competències

  • CG1. - Capacitat per analitzar críticament, a partir de la recollida d'informació i la interpretació de dades, situacions complexes i dissenyar estratègies creatives i innovadores per resoldre-les.
  • CG2. - Saber comunicar-se oralment i per escrit en l'àmbit científic i professional, utilitzant les llengües pròpies i l'anglès.
  • CG3. - Treballar en equip contribuint a l'elaboració de projectes específics i multidisciplinaris.
  • CG4. - Planificar i avaluar la pròpia activitat i el propi aprenentatge i elaborar estratègies per millorar-los aplicant criteris de qualitat.
  • CG5. - Capacitat per actuar, generar propostes i prendre decisions en la investigació i en l'activitat professional amb criteris ètics i de sostenibilitat.
  • CE-2. Saber utilitzar i aplicar de forma segura la instrumentació, les tècniques i les metodologies experimentals pròpies de la disciplina.
  • CE-4. Comprendre, a nivell estructural i funcional, les bases moleculars de les estructures i els processos biològics i les seves aplicacions.
  • CE4 - Saber utilitzar i aplicar de forma segura la instrumentació, les tècniques i les metodologies experimentals pròpies de la disciplina.
  • Comprendre, a nivell estructural i funcional, les bases moleculars de les estructures i els processos biològics i les seves aplicacions.
  • CE-5. Comprendre, a nivell estructural i funcional, les bases cel · lulars i fisiològiques dels éssers vius.
  • Saber utilitzar i aplicar de forma segura la instrumentació, les tècniques i les metodologies experimentals pròpies de la disciplina.
  • Comprendre els processos que determinen el funcionament dels éssers vius, els mecanismes de regulació i la seva manipulació.
  • CE-11. Comprendre els processos que determinen el funcionament dels éssers vius, els mecanismes de regulació i la seva manipulació.
  • CE-12. Identificar les propietats genètiques, fisiològiques i metabòliques dels microorganismes i altres éssers vius d'interès biotecnològic i conèixer les metodologies de manipulació genètica que poden permetre modificar-les per la seva potencial aplicació biotecnològica i clínica.
  • Saber utilitzar i aplicar de forma segura la instrumentació, les tècniques i les metodologies experimentals pròpies de la disciplina.
  • Comprendre, a nivell estructural i funcional, les bases cel.lulars i fisiològiques dels éssers vius.

Continguts

1. LECTURES (Large-size Groups)

          1.1. GENERAL VIROLOGY

                    1.1.1. Origin and Phylogeny. Taxonomical outline.

                    1.1.2. Structure and composition of viral particles: the capside

                    1.1.3. Structure and composition of viral particles: the genome

                    1.1.4. Working with viruses at the laboratory: Manipulation, identification and counting

          1.2. THE VIRAL CYCLE

                    1.2.1. Introduction to the viral cycle

                    1.2.2. Adsorption and viral penetration

                    1.2.3. Regulation of viral gene expression

                    1.2.4. Virion maturation and release

          1.3. EPIDEMIOLOGY and VIRAL PATHOGENESIS

                    1.3.1. Viral pathogenesis at cellular and organismal level

                    1.3.2. Prophylaxis and therapeutics: vaccines and antivirals

                    1.3.3. Viral pathogens

2. CASE STUDIES (Medium-size Groups)

          2.1. Commentary and presentation of scientific research papers

3. LABORATORY EXERCISES (Small-size Groups)

          3.1. One Step Growth cycle: kinetics of phage infection and host dynamics

Activitats

Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Total
Classes expositives 12 0 12
Classes pràctiques 5 0 5
Exposició dels estudiants 0 10,5 10,5
Lectura / comentari de textos 6 8 14
Prova d'avaluació 0 25 25
Resolució d'exercicis 0 6 6
Total 23 49,5 72,5

Bibliografia

  • Norkin, Leonard C (cop. 2010 ). Virology : molecular biology and pathogenesis . Washington, D.C.: ASM Press. Catàleg
  • Mahy, B. W. J. (Brian W. J.) (cop. 2010 ). Desk encyclopedia of human and medical virology . Oxford: Academic. Catàleg
  • Mahy, B. W. J.|q(Brian W. J.) (cop. 2009). The Dictionary of virology (4th ed.). Boston: Elsevier/Academic Press. Catàleg
  • Storch, Gregory A (2000 ). Essentials of diagnostic virology . New York [etc.]: Churchill Livingstone. Catàleg
  • Fields, Bernard N. (cop. 1996 ). Fields virology (3rd ed). Philadelphia [Pa.] [etc.]: Lippincott-Raven. Catàleg
  • Webster, Robert G. (1994 ). Encyclopedia of virology . London [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Levy, Jay A (1994 ). Virology (3rd ed.). Englewood Cliffs: Prentice Hall. Catàleg
  • Dimmock, N.J (1994 ). Introduction to modern virology (4th ed.). Oxford [etc.]: Blackwell Science. Catàleg
  • Harper, David R (1994 ). Molecular virology . Oxford: Bios. Catàleg
  • White, David O (cop. 1994 ). Medical virology (4th ed.). San Diego [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Cann, Alan J (1993 ). Principles of molecular virology . London [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Burleson, Florence G (cop.1992 ). Virology : a laboratory manual . San Diego [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Matthews, R.E.F (1992 ). Fundamentals of plant virology . San Diego [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Dulbecco, Renato (1988 ). Virology (2nd edition). Philadelphia: Lippincott. Catàleg
  • Rao, V.C (1986 ). Environmental virology . Washington: American Society for Microbiology. Catàleg
  • Gerba, Charles P. (cop. 1982 ). Methods in environmental virology . New York [etc]: Marcel Dekker. Catàleg
  • Madigan, Michael T. Guerrero, Ricardo (cop. 2009 ). Brock biología de los microorganismos (12ª ed.). Madrid [etc.]: Pearson Educación. Catàleg

Avaluació i qualificació

Activitats d'avaluació:

Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat %
Global Exam This exam will include questions referring to the theoretical content of the course (Large-size Groups) and some aspects of the case studies presented (Medium-size Groups).

This activity contributes a 45% to the final mark of the course ONLY if its mark is >4.

This activity can be resit.
45
Research Paper Summary This activity consist in summarizing the key concepts, results and conclusions of a previously selected research paper dealing with different aspects of the Course.

This activity contributes a 15% to the final mark.

This activity can not be resit.
15
Case Seminar This activity consist in the presentation of a previously selected research paper dealing with different aspects of the Course. This activity contributes a 20% to the final mark. This activity can not be resit. 20
Lab Report This activity consists in answering several questions related to the experimental results obtained during lab exercises (Small-size Groups).

The mark obtained in this activity contributes a 20% to the final mark of the course.

This activity can not be resit.
20

Qualificació

Evaluation is carried out through three main activities: a lab report, preparation of case seminars and a final exam. It is mandatory to attend laboratory exercises during the scheduled period to pass the course.

The final mark results from the addition of specific contributions of the different activities, as follows:

LAB REPORT (LR): This activity consists in answering several questions related to experimental results obtained during lab exercises (Small-size Groups). The mark obtained in this activity contributes a 20% to the final mark of the course. This activity can not be resit.

CASE STUDIES (CS): This activity consist in the preparation of an oral presentation focused on a previously selected scientific research paper. This activity contributes a 35% to the final mark. This activity can not be resit.

EXAM (EX): This exam will include questions referring to the theoretical content of the course (Large-size Groups) as well as to the cases presented (Medium-size Groups). The mark of this exam must be equal to or higher than 4 to contribute a 45% to the final mark of the course. Students that get marks below 4 must resit the exam.

The final mark of the course results from the sum of individual contributions of each evaluation activity, that is: 20% LR + 35% CS + 45% EX. To pass the course the student should get a mark equal to or higher than 5.


RESIT ACTIVITIES: Those students that get a final mark <5 (or <4 in the Exam) can only resit the exam. This second exam will have the same evaluation criteria and conditions set for the first one and it will be scheduled during the resit examination period.

Criteris específics de la nota «No Presentat»:
To pass the course, students have to:

a) To attend practical sessions (Lab exercises).
b) To submitt the Lab Report in due time.
c) To present the Case Study.
d) To complete the Exam.

Students that do not attend practical sessions and do not submitt any of the evaluation activities will be considered as NON-PRESENTED.

Assignatures recomanades

  • Ampliació de biologia cel·lular
  • Bioenergètica i metabolisme
  • Biologia
  • Biologia molecular
  • Bioquímica
  • Biotecnologia vegetal
  • Ecologia microbiana
  • Fisiologia bacteriana
  • Fonaments de bioinformàtica
  • Genètica
  • Genòmica
  • Microbiologia
  • Microbiologia clínica
  • Pràctiques de biologia molecular
  • Pràctiques de microbiologia
  • Regulació metabòlica